应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » Lammps里面如何使用fene
81/1返回列表
查看: 2477  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

chaonie

铜虫 (初入文坛)

[求助] Lammps里面如何使用fene

我想在模拟时候考虑fene potential， 但是我不知道怎么使用fene的命令，仅仅使用bond_style好像不行，但是我不知道还要使用其他什么命令，谁能帮帮我？？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-02-28 05:43:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
chaizhm(金币+3): 2012-02-28 09:42:02
chaonie(金币+1): ★有帮助 2012-03-01 05:58:06
先仔细看看手册说明：http://lammps.sandia.gov/doc/bond_fene.html

然后要加上：
pair_style       lj/cut/coul/long
pair_modify      shift yes
bond_style        fene
赞一下 回复此楼
2楼2012-02-28 08:48:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xudi1127

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
pair style定不定coul对使用FENE不影响吧，pair_modify 是针对pair_style的修饰。bond_style后面加上bond_coefficient
请版主指正，我也刚刚开始lammps
赞一下 回复此楼
3楼2012-02-28 12:47:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
zh1987hs(金币+5): 谢谢 2012-03-01 07:24:27
引用回帖:
3楼: Originally posted by xudi1127 at 2012-02-28 12:47:47:
pair style定不定coul对使用FENE不影响吧，pair_modify 是针对pair_style的修饰。bond_style后面加上bond_coefficient
请版主指正，我也刚刚开始lammps

恩，多谢你你的提醒。

我之前模拟的时候用过FENE，我当时的模拟FENE势的前一分部和后一部分分开的，所以就写了上面的内容。看到楼主的问题，就直接发了。

非常感谢你的提醒。

用这个势函数，最重要的是在data 文件中把 BOND 部分写好，给好相关的参数值。
赞一下 回复此楼
4楼2012-02-28 14:54:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chaonie

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-02-28 14:54:49:
恩，多谢你你的提醒。

我之前模拟的时候用过FENE，我当时的模拟FENE势的前一分部和后一部分分开的，所以就写了上面的内容。看到楼主的问题，就直接发了。

非常感谢你的提醒。

用这个势函数，最重要的是 ...

必须在data文件里面写bond的信息么？？
赞一下 回复此楼
5楼2012-02-29 04:28:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
5楼: Originally posted by chaonie at 2012-02-29 04:28:06:
必须在data文件里面写bond的信息么？？

是
仔细阅读手册
回复此楼
6楼2012-02-29 07:34:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chaonie

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-02-29 07:34:33:
是
仔细阅读手册

我在手册里面怎么没有找见如何写data. 文件的方法啊？？我自己找了一个data文件然后写改了一下，然后就出现问题了: 我所需要的分子链和墙重合了，这是怎么回事啊？？
赞一下 回复此楼
7楼2012-03-01 06:10:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
7楼: Originally posted by chaonie at 2012-03-01 06:10:22:
我在手册里面怎么没有找见如何写data. 文件的方法啊？？我自己找了一个data文件然后写改了一下，然后就出现问题了: 我所需要的分子链和墙重合了，这是怎么回事啊？？

这是data文件格式：http://lammps.sandia.gov/doc/read_data.html
你参考其他例子里面的格式，多看看就知道怎么写了。


分子链和墙重合，那是因为你的模型没有建好，你可以移动一下分子链或者墙的位置，模拟之前要能量最小化一下http://lammps.sandia.gov/doc/minimize.html
赞一下 回复此楼
8楼2012-03-01 08:33:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chaonie 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 274求调剂 +4 时间点 2026-03-13 4/200 2026-03-15 15:29 by Rambo13
[考研] 材料专硕326求调剂 +4 墨煜姒莘 2026-03-15 4/200 2026-03-15 11:02 by dyw
[考研] 304求调剂 +5 小熊joy 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:07 by peike
[考研] 材料工程327求调剂 +3 xiaohe12w 2026-03-11 3/150 2026-03-14 20:20 by ms629
[考研] 313分生物学求调剂 +6 Yyt杨1 2026-03-09 8/400 2026-03-14 03:00 by JourneyLucky
[考研] 一志愿天大化工（085600）调剂总分338 +6 蔡大美女 2026-03-09 6/300 2026-03-14 02:46 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工 一志愿山大 321分 求调剂 +7 每天散步 2026-03-09 8/400 2026-03-14 02:18 by JourneyLucky
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-09 3/150 2026-03-14 01:57 by JourneyLucky
[考研] 328，0703考生求调剂，一志愿为东北师范大学 +4 观素律 2026-03-09 5/250 2026-03-14 01:24 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +6 yfihxh 2026-03-09 6/300 2026-03-14 01:18 by JourneyLucky
[考研] 312求调剂 +6 陌宸希 2026-03-10 6/300 2026-03-14 00:40 by JourneyLucky
[考研] 材料工程专硕，一志愿中国矿业大学，总分314，求调剂 +5 无懈可击的巨人 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:37 by JourneyLucky
[考研] ［0860］321分求调剂，ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 材料工程调剂 +4 咪咪空空 2026-03-11 4/200 2026-03-13 19:57 by JourneyLucky
[考研] 08食品或轻工求调剂，本科发表3篇sci一区top论文，一志愿南师大食品科学与工程 +3 我是一个兵， 2026-03-10 3/150 2026-03-13 10:21 by Yuyi.
[考研] 270求调剂 085600材料与化工专硕 +3 YXCT 2026-03-11 3/150 2026-03-13 10:13 by houyaoxu
[考博] 26读博 +4 Rui135246 2026-03-12 10/500 2026-03-13 07:15 by gaobiao
[考研] 纺织、生物、化学、材料相关专业招生了 +4 耶耶业 2026-03-09 7/350 2026-03-12 19:05 by Equinoxhua
[考研] 290求调剂 +3 柯淮然 2026-03-10 8/400 2026-03-11 13:48 by 柯淮然
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭