24小时热门版块排行榜    

查看: 2474  |  回复: 7

chaonie

铜虫 (初入文坛)

[求助] Lammps里面如何使用fene

我想在模拟时候考虑fene potential, 但是我不知道怎么使用fene的命令,仅仅使用bond_style好像不行,但是我不知道还要使用其他什么命令,谁能帮帮我??
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
chaizhm(金币+3): 2012-02-28 09:42:02
chaonie(金币+1): 有帮助 2012-03-01 05:58:06
先仔细看看手册说明:http://lammps.sandia.gov/doc/bond_fene.html

然后要加上:
pair_style       lj/cut/coul/long
pair_modify      shift yes
bond_style        fene
2楼2012-02-28 08:48:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xudi1127

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
pair style定不定coul对使用FENE不影响吧,pair_modify 是针对pair_style的修饰。bond_style后面加上bond_coefficient
请版主指正,我也刚刚开始lammps
3楼2012-02-28 12:47:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

zh1987hs(金币+5): 谢谢 2012-03-01 07:24:27
引用回帖:
3楼: Originally posted by xudi1127 at 2012-02-28 12:47:47:
pair style定不定coul对使用FENE不影响吧,pair_modify 是针对pair_style的修饰。bond_style后面加上bond_coefficient
请版主指正,我也刚刚开始lammps

恩,多谢你你的提醒。

我之前模拟的时候用过FENE,我当时的模拟FENE势的前一分部和后一部分分开的,所以就写了上面的内容。看到楼主的问题,就直接发了。

非常感谢你的提醒。

用这个势函数,最重要的是在data 文件中把 BOND 部分写好,给好相关的参数值。


4楼2012-02-28 14:54:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chaonie

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-02-28 14:54:49:
恩,多谢你你的提醒。

我之前模拟的时候用过FENE,我当时的模拟FENE势的前一分部和后一部分分开的,所以就写了上面的内容。看到楼主的问题,就直接发了。

非常感谢你的提醒。

用这个势函数,最重要的是 ...

必须在data文件里面写bond的信息么??
5楼2012-02-29 04:28:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

引用回帖:
5楼: Originally posted by chaonie at 2012-02-29 04:28:06:
必须在data文件里面写bond的信息么??


仔细阅读手册
6楼2012-02-29 07:34:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chaonie

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-02-29 07:34:33:

仔细阅读手册

我在手册里面怎么没有找见如何写data. 文件的方法啊??我自己找了一个data文件然后写改了一下,然后就出现问题了: 我所需要的分子链和墙重合了,这是怎么回事啊??
7楼2012-03-01 06:10:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

引用回帖:
7楼: Originally posted by chaonie at 2012-03-01 06:10:22:
我在手册里面怎么没有找见如何写data. 文件的方法啊??我自己找了一个data文件然后写改了一下,然后就出现问题了: 我所需要的分子链和墙重合了,这是怎么回事啊??

这是data文件格式:http://lammps.sandia.gov/doc/read_data.html
你参考其他例子里面的格式,多看看就知道怎么写了。


分子链和墙重合,那是因为你的模型没有建好,你可以移动一下分子链或者墙的位置,模拟之前要能量最小化一下http://lammps.sandia.gov/doc/minimize.html
8楼2012-03-01 08:33:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chaonie 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国自科面上基金字体 +4 iwuli 2026-03-12 5/250 2026-03-15 17:07 by 风云无泪
[考研] 085600材料与化工 326 求调剂 +5 热爱生活ing 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:39 by JourneyLucky
[考研] 求调剂,药学 +3 归零lbm 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:21 by JourneyLucky
[考研] 085600求调剂 +3 a邵星池 2026-03-09 3/150 2026-03-14 01:32 by JourneyLucky
[基金申请] 有必要更换申报口吗 20+3 fannyamoy 2026-03-11 3/150 2026-03-14 00:52 by zhanghaozhu
[考研] 求调剂,一志愿江南大学环境工程085701 +3 Djdjj12 2026-03-10 4/200 2026-03-14 00:31 by JourneyLucky
[考研] 318求调剂 +3 李新光 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:21 by JourneyLucky
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 5/250 2026-03-13 22:06 by 星空星月
[考研] 求材料调剂 +5 隔壁陈先生 2026-03-12 5/250 2026-03-13 22:03 by 星空星月
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交大,材料专硕317求调剂 +5 lx8568 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:43 by peike
[考研] 材料调剂,307分 +13 张泳铭1 2026-03-09 17/850 2026-03-13 11:09 by 薛云鹏
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +3 d如愿上岸 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:43 by houyaoxu
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +4 薛云鹏 2026-03-13 4/200 2026-03-13 10:40 by 学员8dgXkO
[考研] 工科0856专硕化学工程269能调剂吗 +10 我想读研11 2026-03-10 10/500 2026-03-13 10:14 by Yuyi.
[考博] 福州大学杨黄浩课题组招收2026年专业学位博士研究生,2026.03.20截止 +3 Xiangyu_ou 2026-03-12 3/150 2026-03-13 09:36 by duanwu655
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-12 4/200 2026-03-12 19:33 by 求调剂zz
[考研] 085600 材料与化工 295 求调剂 +10 dream…… 2026-03-10 12/600 2026-03-12 13:46 by dream……
[考研] 0857 资源与环境 285分 +6 未名考生 2026-03-09 6/300 2026-03-11 21:08 by 30660438
[考博] 读博申请 +5 感dd 2026-03-10 7/350 2026-03-11 17:02 by QGZDSYS
信息提示
请填处理意见