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虎虎猪

新虫 (小有名气)

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[求助] 分子对接打多少分有实际意义

在用分子对接的时候打分函数打出的多少分可以证明这次的分子对接有理论意义呢

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1楼 2012-02-24 12:14:03

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longdlut

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呵呵，看构象的集中程度

5楼2012-04-03 20:57:43

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rrssd

新虫 (初入文坛)

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jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-03-08 14:44:37

目前常用的打分函数都比较“无能”……R能做到0.5就已经很不错了。做个参考还是不错的，不要太纠结于具体的分。

2楼2012-02-24 16:53:03

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郝明

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【答案】应助回帖

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jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-03-08 14:44:46

应该是到4.0以上比较好

3楼2012-03-08 14:42:32

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flashlaser

铜虫 (初入文坛)

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

打分是个参考，还要考虑聚类的情况，如果构象分布很集中，那准确度会比较高，构象分布很散，打分就不太可信了。还有就是柔性键数量，高于7个的autodock打分也不太可靠。

4楼2012-03-09 00:34:38

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