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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 分子对接打多少分有实际意义
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虎虎猪

新虫 (小有名气)

[求助] 分子对接打多少分有实际意义

在用分子对接的时候 打分函数打出的多少分 可以证明这次的分子对接有理论意义呢
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1楼 2012-02-24 12:14:03
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rrssd

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★
jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-03-08 14:44:37
目前常用的打分函数都比较“无能”……R能做到0.5就已经很不错了。做个参考还是不错的，不要太纠结于具体的分。
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2楼2012-02-24 16:53:03
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郝明

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-03-08 14:44:46
应该是到4.0以上比较好
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3楼2012-03-08 14:42:32
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flashlaser

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
打分是个参考，还要考虑聚类的情况，如果构象分布很集中，那准确度会比较高，构象分布很散，打分就不太可信了。还有就是柔性键数量，高于7个的autodock打分也不太可靠。
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4楼2012-03-09 00:34:38
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)
呵呵，看构象的集中程度
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5楼2012-04-03 20:57:43
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