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crispsoft金虫 (小有名气)
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[求助]
请教：分子对接后的comsia计算的时候提示没有电荷
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请各位指教;用surflex docking对接完成以后，把构象读入新建的数据库，然后做成分子表格，进行comsia计算的时候提示没有电荷，结果静电场和H供体这两项就无法计算，这是怎么回事啊？ 如console中提示： Unable to compute electrostatic field; comp01_000 has no charges BAD_FILE - File is not in field format. 我之前用fit atom 叠合形成MSS去计算的comsia和comfa结果都是正常的啊？ 对接后把构象对入数据库前要再做什么操作啊？ 我之前在绘制分子的时候已经tripos力场下加过G-H电荷并优化了啊 谢谢！ 刚才我用MSS菜单中的charge项，这样做对不对啊？ 另外，文献中常常说对接后得分最高的构象未必是合适的，需要用LOO看q2来确定最佳构象，这个应该怎么做啊？ [ Last edited by crispsoft on 2012-2-22 at 17:35 ] |
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