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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 请教：分子对接后的comsia计算的时候提示没有电荷
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crispsoft

金虫 (小有名气)

[求助] 请教：分子对接后的comsia计算的时候提示没有电荷

请各位指教;用surflex docking对接完成以后，把构象读入新建的数据库，然后做成分子表格，进行comsia计算的时候提示没有电荷，结果静电场和H供体这两项就无法计算，这是怎么回事啊？
如console中提示：
Unable to compute electrostatic field; comp01_000 has no charges
BAD_FILE - File is not in field format.
我之前用fit atom 叠合形成MSS去计算的comsia和comfa结果都是正常的啊？
对接后把构象对入数据库前要再做什么操作啊？
我之前在绘制分子的时候已经tripos力场下加过G-H电荷并优化了啊
谢谢！

刚才我用MSS菜单中的charge项，这样做对不对啊？

另外，文献中常常说对接后得分最高的构象未必是合适的，需要用LOO看q2来确定最佳构象，这个应该怎么做啊？

[ Last edited by crispsoft on 2012-2-22 at 17:35 ]
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1楼 2012-02-22 16:23:47
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