| 查看: 454 | 回复: 0 | ||
crispsoft金虫 (小有名气)
|
[求助]
请教：分子对接后的comsia计算的时候提示没有电荷
|
|
请各位指教;用surflex docking对接完成以后，把构象读入新建的数据库，然后做成分子表格，进行comsia计算的时候提示没有电荷，结果静电场和H供体这两项就无法计算，这是怎么回事啊？ 如console中提示： Unable to compute electrostatic field; comp01_000 has no charges BAD_FILE - File is not in field format. 我之前用fit atom 叠合形成MSS去计算的comsia和comfa结果都是正常的啊？ 对接后把构象对入数据库前要再做什么操作啊？ 我之前在绘制分子的时候已经tripos力场下加过G-H电荷并优化了啊 谢谢！ 刚才我用MSS菜单中的charge项，这样做对不对啊？ 另外，文献中常常说对接后得分最高的构象未必是合适的，需要用LOO看q2来确定最佳构象，这个应该怎么做啊？ [ Last edited by crispsoft on 2012-2-22 at 17:35 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
面上项目没有好文章就没希望了吗？
已经有22人回复
-
今年也是没消息就是没中么
已经有9人回复
-
买卖文章的刷屏了！
已经有3人回复
-
*O_o^
已经有3人回复
-
*囍
已经有4人回复
-
⊙▽⊙
已经有3人回复
-
T^T
已经有8人回复
-
→_→
已经有4人回复
-
T^T
已经有6人回复
-
T^T
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
请教RNA提取高手：反转录PCR（RT-PCR)中DNA的去除
已经有18人回复
- 蛋白质很纯，但不长晶体
已经有10人回复
- 请教关于DNA 的问题
已经有6人回复
- RNA 提取的一些问题，请大家帮忙回答
已经有13人回复
- 组氨酸标记蛋白的纯化
已经有6人回复
- 如何从已知细胞中P出某个基因，并加上酶切位点？
已经有8人回复
- 酵母双杂交手册
已经有206人回复
- 生活中塑料产品知识 （通俗易懂，加强大家的健康意识）
已经有32人回复
- 原子布居电荷分布
已经有3人回复
- 请教有机分子中O原子和H原子电荷数怎么计算，O-H键键级怎么计算！谢谢！
已经有4人回复
- 【求助】在Syble中用COMSIA法计算分子的Acceptor和Donor数值为零是怎么回事？
已经有9人回复
- 【zhou2009个人文集】关于电荷计算的第二组分子
已经有4人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
