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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » 弱弱地问一个问题：含有金属离子的蛋白如何与小分子对接
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沉潜涵咏

无虫 (正式写手)

[求助] 弱弱地问一个问题：含有金属离子的蛋白如何与小分子对接

弱弱地问一个问题：
含有金属离子的蛋白如何与小分子对接？
小分子化合物与蛋白的作用力包括：与金属离子的螯合作用，其他基团的疏水性作用，氢键作用等。
与不含金属离子的对接有什么不同呢？谢谢了
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管却自家身与心
1楼 2012-02-09 13:05:10
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吴丰旭

金虫 (小有名气)
我也是用gold做金属酶的对接

发自小木虫Android客户端
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4楼2016-10-13 11:08:05
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+5): 鼓励交流 2012-02-09 14:38:43
沉潜涵咏(金币+4): ★★★★★最佳答案 2012-02-17 15:15:26
俺只知道现在做金属酶和小分子对接用的最多的就是GOLD了~其他软件做金属酶和小分子的对接时不考虑金属离子和小分子之间的相互作用的~
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2楼2012-02-09 14:20:43
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qq0317

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-02-09 14:20:43
俺只知道现在做金属酶和小分子对接用的最多的就是GOLD了~其他软件做金属酶和小分子的对接时不考虑金属离子和小分子之间的相互作用的~

你好，你有用过glide来做金属酶和小分子的对接吗？
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3楼2016-07-15 14:31:56
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xufund

至尊木虫 (知名作家)
有没有用autodock或其它免费软件对接的
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5楼2020-12-20 21:03:01
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