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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » Gromacs模拟后，g_angle分析乙烯键角怪异
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小白如水

铁杆木虫 (小有名气)

[求助] Gromacs模拟后，g_angle分析乙烯键角怪异

模拟了乙烯在离子液体中的溶解，整个过程没有报错。结果用g_angle分析乙烯的
H——C——H角度居然在30度左右。。。我们都知道应该在120度左右的。在模拟算法上也限定了氢键不能旋转超过30度，不知道是什么原因，请大家帮忙找找原因。
乙烯参数用的是amber自带的参数
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1楼 2012-01-11 16:04:02
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903566945

金虫 (正式写手)
请问一下，你是怎么用Gromarcs计算的？我才刚学Gromarcs，想请教一下。
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2楼2012-02-11 21:36:45
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