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做完ligand和蛋白的对接后如何跑一个动力学模拟，看看ligand和周围残基的小幅度变化？
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RT，做完对接之后，想看看分子在对接口袋里的有限运动，以及周围残基的变化，用什么软件可以做到呢？请明示！多谢！ |
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这方面用autodock可以么？ 
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