查看: 2974  |  回复: 11
本帖产生 2 个 BioEPI ,点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

tco_001

新虫 (小有名气)

[求助] 关于Q-PCR的一些疑问

最近在做Q-pcr,要扩增一个表达量很底的mRNA
设计了引物上机去做,溶解曲线不单一有两个峰,一个大一点一个小一点,大一点的应该是产物,但两峰高度差距不算太大,距离倒是蛮远的
扩增曲线测定的Ct值在32左右,由于样品的原因,提取的RNA可能不是很纯,RNA浓度也不好提高了
改变过退火温度,变化不大
换过很多引物,由于这个mRNA丰度太低,很多的引物都扩不出来
仪器自动分析的CT值在复孔之间差距0.5以内
想问一下,我这个数据可以用么,如果不行要怎样提高扩增的特异性或者怎样改变一下?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

terry130

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by tco_001 at 2011-11-16 16:38:30:
好吧,主要是没人带就自己在那摸索着做,以前也用电泳摸过的,但是觉得reaLtime的条件和普通pcr的条件不是很一样,照搬的话效果不是很好,但是一调整又觉得不确定了,很矛盾的

不是让你用两台机器啊,是用同一台机器做。只要是同一台机器,条件就是通用的
摒气动方息,宁神心自明。
9楼2011-11-16 21:34:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

terry130

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
silicare(金币+3, BioEPI+1): 2011-11-15 17:53:01
tco_001(金币+10): 2011-11-16 16:38:38
应该是有第二扩增造成的溶解曲线分离。这样的数据不能用的。你必须得换引物,知道找到合适的位置。。你做的基因组有没有全序列信息?如果有的话应该不难找到一对专一的引物。
摒气动方息,宁神心自明。
2楼2011-11-15 08:08:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tco_001

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by terry130 at 2011-11-15 08:08:30:
应该是有第二扩增造成的溶解曲线分离。这样的数据不能用的。你必须得换引物,知道找到合适的位置。。你做的基因组有没有全序列信息?如果有的话应该不难找到一对专一的引物。

那是不是只要我的溶解曲线的峰时单一的就可以认为我的数据是可用的呢?
不知道在哪里看到说ct值超过30得出的结果就不是很可行了,毕竟qpcr的影响因素太多了
3楼2011-11-15 16:35:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

terry130

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by tco_001 at 2011-11-15 16:35:41:
那是不是只要我的溶解曲线的峰时单一的就可以认为我的数据是可用的呢?
不知道在哪里看到说ct值超过30得出的结果就不是很可行了,毕竟qpcr的影响因素太多了

你要理解溶解曲线的含义啊。 他是cycle-signal曲线的导数曲线。一个标准的cycle-signal所对应的溶解曲线就应该是单峰的。这个只是数据可用的必要条件。并不是充分条件。如果你的非特异扩增曲线跟你的特异扩增曲线很相近的话,那么他们的溶解曲线仍然是单峰,但这种情况下的数据也是不可用的。这也是taqman探针法的优势所在了。~
摒气动方息,宁神心自明。
4楼2011-11-15 18:47:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 极限拉扯,如何抉择 +6 Isak0320 2026-10-12 8/400 2026-10-12 20:09 by caixiaoye1
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费,对账才发现官费比别人多掏了一倍 +6 13108017953 2026-10-08 6/300 2026-10-12 20:07 by w3w3y3
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +4 wangyl_123 2026-10-10 8/400 2026-10-12 18:09 by wangyl_123
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +3 好运来~9527 2026-10-10 6/300 2026-10-12 14:55 by 简单化xn
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬,路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见