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liuxing1-1至尊木虫 (知名作家)
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[求助]
做DGGE的土壤样品保存问题
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RT 100bb求助啊。本人要做DGGE，但是土壤样品已经在-20度保存了将近半年时间，而且土样因为含水量低，并没有被冻住，想问问在这种情况下，能做DGGE吗 |
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 读博出国 | 微生物生态学 |
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【答案】应助回帖
liuxing1-1(金币+5): 2011-11-09 09:13:27
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额 同行 土壤微生物群落多样性用DGGE 来做 我目前也是这样 不过我在思考一个问题。DGGE 的分辨能力 有那么高么？？ 我做过最多的是 在一个泳道出现30几条带 但是用脚趾头都能想到土壤里面的微生物群落 肯定不止这么点 就算是土壤在冻了很久之后也不至于只剩这么点存活 所以 DGGE 的分辨能力 很低 用来做小环境的微生物数量有限的样品的时候 很有优势 要是做土壤 我去 ，真TMD 不靠谱 悲催的 可惜我一开始就选错了 路 建议 去做高通量测序。每个样品平均测个1000-2000 条 是目前较为理想的多样性研究方法。 |
9楼2011-11-09 08:59:10
liuxing1-1
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