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z-w-p

新虫 (初入文坛)

[求助] 酿酒酵母基因组PCR出了16S的条带 已有1人参与

实验要用酿酒酵母的基因组全测序。但是在华大16S检测排除细菌污染的时候,发现能P出16S的条带。随后我自己重新划线分离单菌落,重提了基因组DNA,用16S通用引物PCR发现还是有16S的条带出现,请各位大侠给予解释~
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quiller2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

首先,你的酿酒酵母是不是真正的纯培养,既然要做重测序,那么有可能你的菌株在分离的时候就没有得到纯培养,这个非常常见。
所以,将你的培养物在酵母选择性培养基中再次划线培养,可能的话,加入一点儿抗生素来做。多划线几次。

最后,为了确定污染的情况,你可以做一个细菌16S 的qPCR,即拷贝数检测,看看是不是会影响你的全基因组测序。

公司提出的问题实际上比较重要,如果你的细菌污染比例很大,后期分析会非常非常麻烦。
致良知
9楼2014-05-16 22:28:36
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