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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » PCR测序结果出来后怎样在NCBI上进行比对？求各位高手帮忙！
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红色日历

木虫 (小有名气)

[交流] PCR测序结果出来后怎样在NCBI上进行比对？求各位高手帮忙！

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1楼 2011-10-31 09:41:26
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jinpeng_6118

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
西瓜(金币+3): Good！ 2011-12-08 18:48:22
引用回帖:
8楼: Originally posted by 红色日历 at 2011-12-06 10:35:05:
但是要想比对核酸序列呢？
我用第一个比对核酸序列相似性极低，但是用blastX比出来相似性却可以，我迷茫。。。

你要比核算的话最好把你找出序列中完整的ORF，然后把这个ORF直接进行Blastn，这样才能得到比较相似性的结果的
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红色日历
9楼2011-12-06 15:35:27
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huguangdong

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
红色日历(金币+3): 谢谢 2011-10-31 14:57:09
blast比对，很简单，但是说起来就很麻烦，建议百度搜索一下，那里的教程可能会更容易懂一点。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-10-31 10:44:48
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imyting

至尊木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
红色日历(金币+3): 谢谢！ 2011-10-31 14:57:23
与目的基因序列一起建一个TXT文档（格式：>序列1      
                                                            >序列2），
进EBI的clustalw进行在线比对
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3楼2011-10-31 12:11:20
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water_0428

新虫 (初入文坛)
红色日历(金币+1): 2011-10-31 17:17:17
Blast  
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4楼2011-10-31 15:07:10
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