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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 测序结果比对问题
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bevan09

禁虫 (小有名气)
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1楼 2011-10-27 15:45:14
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illcf_11

银虫 (初入文坛)
不知道你的序列是已知功能的么？还是未知来源的，只是拿到了一条16S rDNA，想知道你的基因在坏境中的系统进化树的位置？
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2楼2011-10-27 15:54:44
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bevan09

禁虫 (小有名气)
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3楼2011-10-27 16:09:17
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xyj114114

木虫 (著名写手)
★
西瓜(金币+1): 鼓励交流 2011-10-28 15:38:06
寻找Planctomycetales bacterium 的模式菌株，再做进化树
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bevan09
4楼2011-10-28 09:55:44
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bevan09

禁虫 (小有名气)
送鲜花一朵
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5楼2011-10-28 10:23:45
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xyj114114

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
wanhscn(金币+3): 鼓励应助回帖! 2011-10-29 11:15:04
引用回帖:
5楼: Originally posted by bevan09 at 2011-10-28 10:23:45:
我试了，搜索Gene里的，只有两个，要是搜索Nucleotide，里面都是未培养的菌呀？

Planctomycetales bacterium ,看文献找较快，再搜出它们的序列
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6楼2011-10-29 08:28:57
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bevan09

禁虫 (小有名气)
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7楼2011-10-29 08:49:26
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zz716

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

bevan09(金币+1): 能说具体点么？ 2011-10-30 19:31:39
bevan09(金币+1): 2011-12-16 16:55:01
到NCBI中比对看什么菌
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8楼2011-10-30 10:45:21
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pcl-bunny

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

bevan09(金币+3): 这个网站之前没听过哦！我查了下，只有一两个。 2011-10-30 22:37:37
bevan09(金币+2): 2011-12-16 16:55:10
到RDP上找，专门的16S比对网站。里面的设置可以帮你找到已知菌株的序列，用同源性较高的建树。
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NOPAIN,NOGAIN!
9楼2011-10-30 17:44:11
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billowzeng

金虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by pcl-bunny at 2011-10-30 17:44:11:
到RDP上找，专门的16S比对网站。里面的设置可以帮你找到已知菌株的序列，用同源性较高的建树。

请问RDP网站是哪个呀?谢谢!
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10楼2011-11-01 08:49:56
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