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lhm_hnyj金虫 (小有名气)
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【求助/交流】测序结果整不明白 已有7人参与
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分子生物学新手有问题请教哈。 真菌ITS通用引物PCR产物送公司克隆测序，载体为Takara的PMD-18T，序列之一TTCGAaTTCGAGCTCGGTACCCGGGGATCCTCTAGAGATTACCGGTGGTAGCCCTGAACCCGGCTACACTGCTCCCACTGCCTGAGGAAGGGCTGCAACACAACTGCCTTGATATCCTGGCCGAAGCCCACGGAACCCGACCCGACCTAGCGGACCAGCCGCTCCCAGACGCCGACCACACCTGGTACACGGATGGAAGCAGTCTCTTGCAAGAGGGACAGCGTAAGGCGGGAGCTGCGGTGACCACCGAGACCGAGGTAATCTGGGCTAAAGCCCTGCCAGCCGGGACATCCGCTCAGCGGGCTGAACTGATAGCACTCACCCAGGCCCTAAGGATGGCAGAAGGTAAGAAGCTAAATGTTTATACTGATAGCCGTTATGCTTTTGCTACTGCCCATATCCATGGAGAAATATACAGAAGGCGTGGGTTGCTCACATCAGAAGGCAAAGAGATCAAAAATAAGGACGAGATCTTGGCCCTACTAAAAGCCCTCTTTCTGCCCAAAAGACTTAGCATAATCCATTGTCCAGGACATCAAAAGGGACACAGCGCCGAGGCTAGAGGCAACCGGATGGCTGACCAAGCGGCCCGAAAGGCAGCCATCACAGAGAATCCAGACACCTCTACCCTCCTCATAGAAAATTCATCGCCCAATTCCCGCTTAATTATTCATCACCATCATCACCATTAATAAGCTTGGCTGTTTTGGCGGATGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCAGAACGCAGAAGCGGTCTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGAATCGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTGGCACTGGCCGTCGTTTTACAACGTCGTGACTGGGAAAACCCTGGCGTTACCCAACTTAATCGCCTTGCAGCACATCCCCCTTTCGCCAGCTGGCGTAATAGCGAAGAGGCCCGCACCGATCGCCCTTCCCAACAGTTGCGCAGCCTGAATGGCGAATGGCGCCTGATGCGGTATTN 直接去NCBI比对没有想要的结果，是该先去掉某段吗？请大家谁帮忙分析下哈。谢谢了。还有，抱歉的是不知道测序图怎么贴上来，所以没法给大家看图 |
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2楼2010-08-27 23:14:24
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应该去打掉克隆载体的序列，你的ITS系列为： ACCGGTGGTAGCCCTGAACCCGGCTACACTGCTCCCACTGCCTGAGGAAGGGCTGCAACACAACTGCCTTGATATCCTGG CCGAAGCCCACGGAACCCGACCCGACCTAGCGGACCAGCCGCTCCCAGACGCCGACCACACCTGGTACACGGATGGAAGC AGTCTCTTGCAAGAGGGACAGCGTAAGGCGGGAGCTGCGGTGACCACCGAGACCGAGGTAATCTGGGCTAAAGCCCTGCC AGCCGGGACATCCGCTCAGCGGGCTGAACTGATAGCACTCACCCAGGCCCTAAGGATGGCAGAAGGTAAGAAGCTAAATG TTTATACTGATAGCCGTTATGCTTTTGCTACTGCCCATATCCATGGAGAAATATACAGAAGGCGTGGGTTGCTCACATCA GAAGGCAAAGAGATCAAAAATAAGGACGAGATCTTGGCCCTACTAAAAGCCCTCTTTCTGCCCAAAAGACTTAGCATAAT CCATTGTCCAGGACATCAAAAGGGACACAGCGCCGAGGCTAGAGGCAACCGGATGGCTGACCAAGCGGCCCGAAAGGCAG CCATCACAGAGAATCCAGACACCTCTACCCTCCTCATAGAAAATTCATCGCCCAATTCCCGCTTAATTATTCATCACCAT CATCACCATTAATAAGCTTGGCTGTTTTGGCGGATGAGAGAAGATTTTCAGCCTGATACAGATTAAATCAGAACGCAGAA GCGGTCTGATAAAACAGAATTTGCCTGGCGAA |
3楼2010-08-28 01:25:06
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