应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 如何快速 找到所有膜蛋白
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 3416  |  回复: 20
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
本帖产生 1 个 MolEPI ，点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

Sofia1004

新虫 (小有名气)

[求助] 如何快速 找到所有膜蛋白

我的老板 让我 把 解淀粉芽孢杆菌 的所有膜蛋白找到，我在NCBI 上一看，解淀粉芽孢杆菌的基因组 有391万bp啊，一个一个的看是不是膜蛋白 得弄到猴年马月啊，求高人指点 怎么高效的筛选出 所有的膜蛋白啊？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

【分子生物】EPI帖

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-10-25 10:15:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

Sofia1004(金币+7): 非常感谢！ 2011-10-28 08:37:34
引用回帖:
7楼: Originally posted by Sofia1004 at 2011-10-25 15:45:58:
谢谢你给我金币，感激涕零ing 。
你说的这些方法 有道理。指明了我做下一步的方法，谢谢！
我现在是要找着 基因组中 是，或者可能是膜蛋白的 所有蛋白。希望能有一个方法快速检索出来。
如下面链接[url]http: ...

通过比对预测它是膜蛋白 hypothetical （假定的 有可能的）membrane protein [Bacillus amyloliquefaciens FZB42]
因此有两个可能的结构域也很正常
第一个是 从aa 28到aa354 预测为Predicted permease, member of the PurR regulon 参考序列为 CDD:30973
第二个可能 从aa 40到aa 342 预测为 Domain of unknown function DUF20 参考序列为 CDD:186015
没有实验验证，只有预测。
由于很多信息的价值以及可靠性存在差异，生物信息学很多研究以及序列需要一个一个看，那些批量性的程序还是值得商榷的。
赞一下 回复此楼
真相是最大的奢侈品
8楼2011-10-25 21:21:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 21 个回答

wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

★
西瓜(金币+1): good 2011-10-25 17:55:28
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3330923
如果你会用这个，应该有所帮助了！
赞一下(1人) 回复此楼
真相是最大的奢侈品
2楼2011-10-25 10:57:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bubble1220

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
西瓜(金币+1): 鼓励交流 2011-10-25 17:55:55
膜蛋白是不是一般都有信号肽？NCBI查到的基因组会给出所有的信号肽，这样就减少了你的查找范围，不知道对楼主有没有帮助
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-10-25 12:32:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Sofia1004

新虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★
wanhscn(金币+5): 根据论坛精神，新虫发帖给与高额度鼓励！ 2011-10-25 14:50:05
引用回帖:
2楼: Originally posted by wanhscn at 2011-10-25 10:57:19:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3330923
如果你会用这个，应该有所帮助了！

呜呜，金币太少了，没权限啊
不过我在网上查了 一些NCBI教程什么的，看了之后，还是不知我的问题如何解决，不过，还是谢谢你了！
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-10-25 14:48:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 21 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿北化085600材料专硕275|有文章专利｜求调剂 +5 Micky11223 2026-03-25 5/250 2026-03-28 15:02 by 果果妈咪
[考研] 0856求调剂 +11 zhn03 2026-03-25 12/600 2026-03-28 13:32 by 唐沐儿
[考研] 0703一志愿9，初试成绩：338，四六级已过，有科研经历，求调剂！ +4 Zuhui0306 2026-03-25 4/200 2026-03-28 13:07 by 唐沐儿
[考研] 材料与化工考研调剂 +17 孅華 2026-03-22 17/850 2026-03-28 08:35 by WYUMater
[考研] 083000学硕274求调剂 +7 Li李鱼 2026-03-26 7/350 2026-03-28 08:01 by baoball
[材料工程] 一志愿C9材料与化工专业总分300求调剂 +8 曼111 2026-03-24 9/450 2026-03-28 07:58 by YYYYX1234
[考研] 340求调剂 +5 jhx777 2026-03-27 5/250 2026-03-28 04:18 by fmesaito
[考研] 085701环境工程求调剂 +9 多久上课 2026-03-27 9/450 2026-03-28 03:58 by fmesaito
[考研] 求调剂323材料与化工 +7 1124361 2026-03-24 7/350 2026-03-27 10:22 by wangjy2002
[考研] 359求调剂 +4 王了个楠 2026-03-25 4/200 2026-03-27 08:43 by 不吃魚的貓
[考研] 求调剂 +8 Auroracx 2026-03-22 8/400 2026-03-26 19:55 by 不吃魚的貓
[考研] 机械学硕310分，数一英一，一志愿211本科双非找调剂信息 +3 @357 2026-03-25 3/150 2026-03-26 16:34 by by.MENG
[考研] 085601求调剂总分293英一数二 +4 钢铁大炮 2026-03-24 4/200 2026-03-26 16:28 by dick_runner
[考研] 一志愿天津大学339材料与化工求调剂 +3 江往卖鱼 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:42 by 王小欠i
[考研] 282求调剂 +3 wcq131415 2026-03-24 3/150 2026-03-25 12:16 by userper
[考研] 085404电子信息284分求调剂 +4 13659058978 2026-03-24 4/200 2026-03-24 12:15 by syl20081243
[考研] 361求调剂 +3 Glack 2026-03-22 3/150 2026-03-23 22:03 by fuyu_
[考研] 269求调剂 +4 我想读研11 2026-03-23 4/200 2026-03-23 21:25 by pswait
[考研] 280分求调剂 一志愿085802 +4 PUMPT 2026-03-22 7/350 2026-03-22 22:13 by 星空星月
[考研] 275求调剂 +6 shansx 2026-03-22 8/400 2026-03-22 15:27 by barlinike
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭