应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 如何快速 找到所有膜蛋白
51/1返回列表
查看: 3950  |  回复: 20
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
本帖产生 1 个 MolEPI ，点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

Sofia1004

新虫 (小有名气)

[求助] 如何快速 找到所有膜蛋白

我的老板 让我 把 解淀粉芽孢杆菌 的所有膜蛋白找到，我在NCBI 上一看，解淀粉芽孢杆菌的基因组 有391万bp啊，一个一个的看是不是膜蛋白 得弄到猴年马月啊，求高人指点 怎么高效的筛选出 所有的膜蛋白啊？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

【分子生物】EPI帖

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-10-25 10:15:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

Sofia1004(金币+7): 非常感谢！ 2011-10-28 08:37:34
引用回帖:
7楼: Originally posted by Sofia1004 at 2011-10-25 15:45:58:
谢谢你给我金币，感激涕零ing 。
你说的这些方法 有道理。指明了我做下一步的方法，谢谢！
我现在是要找着 基因组中 是，或者可能是膜蛋白的 所有蛋白。希望能有一个方法快速检索出来。
如下面链接[url]http: ...

通过比对预测它是膜蛋白 hypothetical （假定的 有可能的）membrane protein [Bacillus amyloliquefaciens FZB42]
因此有两个可能的结构域也很正常
第一个是 从aa 28到aa354 预测为Predicted permease, member of the PurR regulon 参考序列为 CDD:30973
第二个可能 从aa 40到aa 342 预测为 Domain of unknown function DUF20 参考序列为 CDD:186015
没有实验验证，只有预测。
由于很多信息的价值以及可靠性存在差异，生物信息学很多研究以及序列需要一个一个看，那些批量性的程序还是值得商榷的。
赞一下 回复此楼
真相是最大的奢侈品
8楼2011-10-25 21:21:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 21 个回答

wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

★
西瓜(金币+1): good 2011-10-25 17:55:28
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3330923
如果你会用这个，应该有所帮助了！
赞一下(1人) 回复此楼
真相是最大的奢侈品
2楼2011-10-25 10:57:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bubble1220

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
西瓜(金币+1): 鼓励交流 2011-10-25 17:55:55
膜蛋白是不是一般都有信号肽？NCBI查到的基因组会给出所有的信号肽，这样就减少了你的查找范围，不知道对楼主有没有帮助
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-10-25 12:32:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Sofia1004

新虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★
wanhscn(金币+5): 根据论坛精神，新虫发帖给与高额度鼓励！ 2011-10-25 14:50:05
引用回帖:
2楼: Originally posted by wanhscn at 2011-10-25 10:57:19:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3330923
如果你会用这个，应该有所帮助了！

呜呜，金币太少了，没权限啊
不过我在网上查了 一些NCBI教程什么的，看了之后，还是不知我的问题如何解决，不过，还是谢谢你了！
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-10-25 14:48:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 21 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 厉娜 +3 张丹枫1991 2026-11-09 4/200 2026-11-09 16:48 by 张丹枫1991
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 15/750 2026-11-09 13:19 by Equinoxhua
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 14/700 2026-11-09 11:52 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 16/800 2026-11-09 11:47 by GwrQVVR6Oenx
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 15/750 2026-11-09 11:41 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 10/500 2026-11-09 08:00 by IhnEQauGmT3K
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 12/600 2026-11-09 06:32 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-08 23:01 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 9/450 2026-11-08 22:46 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 延安大学回应“副教授留绝笔信”：确已离世，正核实举报内容 +3 yexuqing 2026-11-04 5/250 2026-11-07 13:22 by 苏东坡二世
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 12/600 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭