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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 有谁能帮我看下我的测序峰图效果如何
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bevan09

禁虫 (小有名气)
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【分子生物】EPI帖

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1楼 2011-10-18 08:39:04
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

bevan09(金币+8): 非常感谢！ 2011-10-18 12:13:53
amisking(MolEPI+1): 鼓励应助发帖！ 2011-10-18 21:48:00
amisking(MolEPI+1): 鼓励应助发帖！ 2011-10-18 21:48:01
引用回帖:
1楼: Originally posted by bevan09 at 2011-10-18 08:39:04:
我的测序结果出来了，可是打不开，也不知道要用什么格式打开。好像可以用FASTA格式，可是这个软件又下不下来，郁闷！只能在MEGA里能打开。可是那个图我都看不懂，麻烦哪位高人帮忙看下，结果怎么样啊?[filename ...

再给你一下这个东，使用简单，open这个测序ab1文件即可
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3楼2011-10-18 10:30:08
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普通回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

测的可以，能用的有600bp吧，看峰图用chromas这个软件。
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2楼2011-10-18 10:28:19
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Zedone

木虫 (正式写手)
分的挺开的，一般第一次测序结果后，测序公司会附带chromas给你的
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4楼2011-10-18 20:46:24
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hnzhaolongfei

木虫 (著名写手)

将军
50以前，700以后的序列不准确，用时比对时有可能截去
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

bevan09
天行健，君子以自强不息；地势坤，君子以厚德载物
5楼2011-10-19 23:46:28
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bevan09

禁虫 (小有名气)
送鲜花一朵
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6楼2011-10-20 08:43:54
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mdehua
7楼2011-10-20 11:48:03
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bevan09

禁虫 (小有名气)
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8楼2011-10-20 18:33:49
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闲花落地

铜虫 (初入文坛)
一般的做法是，先用Chromas软件（该软件可以在网上免费下载，搜一下即可）分析测序的峰图是否可靠，有没有酒精峰，一般普通测序前面的20-30bp不可靠需要截除，后面一般到到600-800bp，视测序样品等因素而定。
序列拼接或引物去除等可应通过DNAStar的Seqedit软件处理。
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9楼2011-10-24 09:47:54
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wxq999

新虫 (小有名气)
西瓜:编辑内容 2011-10-24 17:50
-------------广告内容-----------------
该虫多次发布广告，为了避免版主刷管理记录的嫌疑，不再每个帖子单独扣分，而是分几次重罚。请自重，勿扰乱论坛的正常交流！

[ Last edited by 西瓜 on 2011-10-24 at 17:50 ]
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10楼2011-10-24 16:59:50
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