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墨池

银虫 (小有名气)

[求助] 各位虫友们帮帮忙，公司测序的峰图出来了，可是小女子看不太明白呀

各位虫友们帮帮忙，公司测序的峰图出来了，可是看不太明白呀，怎么找不到自己的引物呀 ，而且公司说测出来是双峰，我基础差，什么是双峰，套峰，前双峰，后双峰呢
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阳光暖暖的，心情暖暖的，努力做个精致的女人！
1楼 2011-05-03 20:32:31
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nuoyaeva

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
墨池(金币+2): 2011-05-03 22:03:08
西瓜(金币+3): 鼓励~话说您每次回帖后面都是这表情啊，呵呵 2011-05-04 00:39:17
墨池(金币+1): 2011-05-04 18:50:42
引物那段肯定是很dirty的序列，并且error很多，你把你的模板序列发上来看看。
你需要比较的是中间比较clean的序列，和模板比较，看有没有突变，要是有突变，就check这个测序的峰图，看看是真的突变，还是因为测序的错误。
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生活是美好的
2楼2011-05-03 21:18:44
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墨池

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by nuoyaeva at 2011-05-03 21:18:44:
引物那段肯定是很dirty的序列，并且error很多，你把你的模板序列发上来看看。
你需要比较的是中间比较clean的序列，和模板比较，看有没有突变，要是有突变，就check这个测序的峰图，看看是真的突变，还是因为测序 ...

我这个没模板序列，第一次做耶
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阳光暖暖的，心情暖暖的，努力做个精致的女人！
3楼2011-05-03 21:27:08
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nuoyaeva

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

墨池(金币+1): 2011-05-04 18:51:04
我说的是目的条带的序列，那你说说你这个送去测序的片段是什么？
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生活是美好的
4楼2011-05-03 21:38:57
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墨池

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by nuoyaeva at 2011-05-03 21:38:57:
我说的是目的条带的序列，那你说说你这个送去测序的片段是什么？

ITS序列
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阳光暖暖的，心情暖暖的，努力做个精致的女人！
5楼2011-05-03 22:02:48
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liulinlin123

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

墨池(金币+1): 2011-05-04 18:51:23
貌似你的模版质量不好啊
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6楼2011-05-04 10:58:29
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墨池

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by liulinlin123 at 2011-05-04 10:58:29:
貌似你的模版质量不好啊

请问，怎么判断是模版质量不好呢，谢谢
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阳光暖暖的，心情暖暖的，努力做个精致的女人！
7楼2011-05-04 15:02:04
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101202139

铜虫 (小有名气)
一个反应测序能够测大约八九百bp，好的话也就是1Kb的样子，而且在测序开始20、30bp和末尾的序列都是不太准的，可以忽略不看。至于你出现双峰的现象很可能是污染了！你认真检查一下。好的峰图就是一个碱基对应一个峰。
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8楼2012-06-11 17:31:51
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