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墨池

银虫 (小有名气)

[求助] 各位虫友们帮帮忙,公司测序的峰图出来了,可是小女子看不太明白呀

各位虫友们帮帮忙,公司测序的峰图出来了,可是看不太明白呀,怎么找不到自己的引物呀 ,而且公司说测出来是双峰,我基础差,什么是双峰,套峰,前双峰,后双峰呢
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阳光暖暖的,心情暖暖的,努力做个精致的女人!
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nuoyaeva

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
墨池(金币+2): 2011-05-03 22:03:08
西瓜(金币+3): 鼓励~话说您每次回帖后面都是这表情啊,呵呵 2011-05-04 00:39:17
墨池(金币+1): 2011-05-04 18:50:42
引物那段肯定是很dirty的序列,并且error很多,你把你的模板序列发上来看看。
你需要比较的是中间比较clean的序列,和模板比较,看有没有突变,要是有突变,就check这个测序的峰图,看看是真的突变,还是因为测序的错误。
生活是美好的
2楼2011-05-03 21:18:44
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墨池

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by nuoyaeva at 2011-05-03 21:18:44:
引物那段肯定是很dirty的序列,并且error很多,你把你的模板序列发上来看看。
你需要比较的是中间比较clean的序列,和模板比较,看有没有突变,要是有突变,就check这个测序的峰图,看看是真的突变,还是因为测序 ...

我这个没模板序列,第一次做耶
阳光暖暖的,心情暖暖的,努力做个精致的女人!
3楼2011-05-03 21:27:08
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nuoyaeva

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

墨池(金币+1): 2011-05-04 18:51:04
我说的是目的条带的序列,那你说说你这个送去测序的片段是什么?
生活是美好的
4楼2011-05-03 21:38:57
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墨池

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by nuoyaeva at 2011-05-03 21:38:57:
我说的是目的条带的序列,那你说说你这个送去测序的片段是什么?

ITS序列
阳光暖暖的,心情暖暖的,努力做个精致的女人!
5楼2011-05-03 22:02:48
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liulinlin123

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

墨池(金币+1): 2011-05-04 18:51:23
貌似你的模版质量不好啊
6楼2011-05-04 10:58:29
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墨池

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by liulinlin123 at 2011-05-04 10:58:29:
貌似你的模版质量不好啊

请问,怎么判断是模版质量不好呢,谢谢
阳光暖暖的,心情暖暖的,努力做个精致的女人!
7楼2011-05-04 15:02:04
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101202139

铜虫 (小有名气)

一个反应测序能够测大约八九百bp,好的话也就是1Kb的样子,而且在测序开始20、30bp和末尾的序列都是不太准的,可以忽略不看。至于你出现双峰的现象很可能是污染了!你认真检查一下。好的峰图就是一个碱基对应一个峰。
8楼2012-06-11 17:31:51
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