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rainandstar

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[求助] G09集群计算结果的chk文件转换问题

各位好，我用的是系里的集群服务器，在Linux上进行G09计算的。现在我想看一下一个结构的electrostatic potential surface，这个应该在Gview中查看chk文件才能实现。我已得到chk文件，但是查了手册才发现，在自己的电脑（windows）上，还要在转换为fchk文件才行。
我根据手册和版上几个帖子中提到的方法进行了尝试，结果失败了，下面是我的过程，有经验的同学请帮忙看看问题出在什么地方，应该怎么解决。谢谢

1，我首先尝试SSH远程登录到cluster上直接实现，具体为进入完成该任务的lanth，进入其中g09的目录，输入formchk /home/name/**.chk /home/name/**fchk，给出的提示是command not found。

2，我把得到的chk文件下到自己的电脑上，然后用g9w中的formchk时也不能转换格式，显示为：
Bad file opened by FileIO: Unit=2 I= 2 FPrev=40960 FCur= 0.
FileIO: IOper= 9 IFileNo<1>= 2 Len=       0 IPos=          0 Q=
4573204
Error termination in NtrErr:
NtrErr called from FileIO.
不知道这个是什么原因。

3，接着上面的情况，我直接把chk文件复制到\g09w\scratch中，然后运行formchk c:\g09w\scratch\**.chk  c:\g09w\scratch\**fchk，屏幕显示为：
fname=c:\g09w\scratch\**.chk  fd = -1

fname=c:\g09w\scratch\**.chk  fd = -1

open-new-file
open-new-file:Invalid argument

总结下来，感觉在SSH上远程用Linux或者在自己电脑上有G09 windows应该都是可以的，但是我不知道哪里的命令写的不对。恩，就是这样了，请多指教。thanks

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1楼2011-09-02 11:28:01

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xj544

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【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 2011-09-02 15:27:52

运行formchk 命令要用绝对路径，比如g09安装在/home,就在终端输入：
/home/g09/formchk *.chk
Good Luck to you!

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2楼2011-09-02 15:06:52

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【答案】应助回帖

rainandstar(金币+10): 完全正确，已经解决 2011-09-02 21:32:36

运行formchk 命令要用绝对路径，比如g09安装在/home,就在终端输入：
/home/g09/formchk *.chk

就行了。
Good Luck to you!

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C-Young

3楼2011-09-02 15:07:39

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yuanzou3015

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非常感谢xj544 。
我也遇到了同样的问题，以前在远程上用g03计算完，可以直接输入
formchk ***.chk，将chk文件转化成fchk文件。
最近换成g09计算后，每次输入formchk ***.chk，都会出现下面的错误：
Error termination in NtrErr:
NtrErr called from FileIO
网上搜索了一遍后，刚按照xj544介绍的方法，将命令改成绝对路径，即/opt/g09/formchk ***.chk(g09装在opt文件下)，就可以了。
建议楼主也试试吧。

再次感谢。

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4楼2011-11-01 16:09:39

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