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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » Gaussian 09 计算出来的chk文件无法转化成fchk文件，求高手指教！
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wuhen116

木虫 (正式写手)

[求助] Gaussian 09 计算出来的chk文件无法转化成fchk文件，求高手指教！

我用Gaussian 09 计算了一个激发态（T2），想用formchk密令生成fchk文件查看HOMO 和 LUMO前线轨道，但是不能成功转化，我输入密令为（formchk 123.chk）然后回车，用Gaussian 03计算出来的文件就可以正常转化。出错提示是：
formchk TPA-A-T2-iop.chk
Read checkpoint file TPA-A-T2-iop.chk
Write formatted file TPA-A-T2-iop.fchk
Operation on file out of range.
FileIO: IOper= 2 IFilNo(1)=-20502 Len=       44100 IPos=           0 Q=         13505568


dumping /fiocom/, unit = 2 NFiles =    47 SizExt =    262144 WInBlk =      4096
                   defal = F LstWrd =     3776512 FType=2 FMxFil=10000

Number           0          0          0          0          0        501        502        503
Base        942593    1665099     545555      41986    3453966    1092044    1093044    3364354
End        1092044    1903333     704359     204578    3776512    1093044    1097746    3364616
End1       1092044    1903333     704359     204578    3776512    1093044    1097746    3364616
Wr Pntr     942593    1665099     545555      41986    3453966    1092044    1093044    3364354
Rd Pntr     942593    1665099     545555      41986    3453966    1092044    1093044    3364354
Length      149451     238234     158804     162592     322546       1000       4702        262

Number         508        511        520        521        522        524        526        536
Base         40960    1100526    1141304    1194351      41190    1194414    1352818     204578
End          40990    1111703    1141314    1194386      41986    1352818    1511222     283979
End1         40990    1111703    1141314    1194386      41986    1352818    1511222     283979
Wr Pntr      40960    1100526    1141304    1194351      41190    1194414    1352818     204578
Rd Pntr      40960    1100526    1141304    1194351      41190    1194414    1352818     204578
Length          30      11177         10         35        796     158404     158404      79401

Number         538        545        548        551        552        561        562        569
Base        283979    1194386    1511222    1141350    1141314    1134936    1134937    1141388
End         363380    1194414    1660870    1141388    1141350    1134937    1141304    1141390
End1        363380    1194414    1660870    1141388    1141350    1134937    1141304    1141390
Wr Pntr     283979    1194386    1511222    1141350    1141314    1134936    1134937    1141388
Rd Pntr     283979    1194386    1511222    1141350    1141314    1134936    1134937    1141388
Length       79401         28     149648         38         36          1       6367          2

Number         575        584        603        605        607        619        631        633
Base       1141390    1113039     704389     704359    3395487    1660870    3091964    1903333
End        1194351    1113213     942593     704389    3395863    1665099    3363892    3091964
End1       1194351    1113213     942593     704389    3395863    1665099    3363892    3091964
Wr Pntr    1141390    1113039     704389     704359    3395487    1660870    3091964    1903333
Rd Pntr    1141390    1113039     704389     704359    3395487    1660870    3091964    1903333
Length       52961        174     238204         30        376       4229     271928    1188631

Number         635        665        670        672        674        694        695        698
Base        363380    1111703    1097746    3363892    3364061    3395863    1113213    3364616
End         545555    1113039    1100526    3364061    3364354    3396615    1114140    3364790
End1        545555    1113039    1100526    3364061    3364354    3396615    1114140    3364790
Wr Pntr     363380    1111703    1097746    3363892    3364061    3395863    1113213    3364616
Rd Pntr     363380    1111703    1097746    3363892    3364061    3395863    1113213    3364616
Length      182175       1336       2780        169        293        752        927        174

Number         701        770        773        989        993        997        998
Base       3364790    3395423    3396615    1114140    1134140    1134340      40990
End        3395423    3395487    3453966    1134140    1134340    1134936      41190
End1       3395423    3395487    3453966    1134140    1134340    1134936      41190
Wr Pntr    3364790    3395423    3396615    1114140    1134140    1134340      40990
Rd Pntr    3364790    3395423    3396615    1114140    1134140    1134340      41090
Length       30633         64      57351      20000        200        596        200
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.
Segmentation fault

请高手指教，怎么能成功转化 g09计算出来的chk文件为fchk文件。谢谢！！！
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1楼 2012-06-21 16:28:45
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wuhen116: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-06-22 00:23:30
似乎是.chk文件太大，超出了限度。

其实查看HOMO 和 LUMO前线轨道，不用写.chk。
加关键词：output=wfn，并在分子数据之后给出wfn的路径和文件名即可。
wfn文件极小，可在multiwfn中作出HOMO 和 LUMO前线轨道来。
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2楼2012-06-21 20:23:09
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loovfnd

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2012-06-21 20:23:09
似乎是.chk文件太大，超出了限度。

其实查看HOMO 和 LUMO前线轨道，不用写.chk。
加关键词：output=wfn，并在分子数据之后给出wfn的路径和文件名即可。
wfn文件极小，可在multiwfn中作出HOMO 和 LUMO前线轨道来 ...

multiwfn是免费的吗？
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莫强求！
3楼2012-06-21 21:56:56
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wuhen116

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2012-06-21 20:23:09
似乎是.chk文件太大，超出了限度。

其实查看HOMO 和 LUMO前线轨道，不用写.chk。
加关键词：output=wfn，并在分子数据之后给出wfn的路径和文件名即可。
wfn文件极小，可在multiwfn中作出HOMO 和 LUMO前线轨道来 ...

你好：
我还有两个疑问，我想再问一下可以吗：
1.output=wfn 是在优化结构的时候加对吗？如下：
%chk=123
# b3lyp/6-31g* opt freq output=wfn
blank line
description
blank line
0 1
coordinate
是这样写输入文件吗？
2.“分子数据之后”是什么意思，不太明白，可不可以给举个实际例子？
多谢，希望得到你耐心地指教！
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4楼2012-06-22 00:31:05
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spearous

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wuhen116: 金币+5, ★有帮助 2012-06-22 10:17:45
以前论坛上有一些类似问题，替你搜了一下：
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1809011

里面提到你可能是用了G03的formchk去转换G09的checkpoint文件，所以报错了。
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5楼2012-06-22 06:18:57
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
wuhen116: 金币+35, ★★★★★最佳答案 2012-06-22 10:17:58
引用回帖:
4楼: Originally posted by wuhen116 at 2012-06-22 00:31:05
你好：
我还有两个疑问，我想再问一下可以吗：
1.output=wfn 是在优化结构的时候加对吗？如下：
%chk=123
# b3lyp/6-31g* opt freq output=wfn
blank line
description
blank line
0 1
coordinate
是这样 ...

H2O的算例：

# HF/6-311++G** POP=FULL  output=wfn   

H2O

0,1
8        0.000000    0.113059    0.000000
1        0.752685   -0.452252    0.000000
1       -0.752685   -0.452220    0.000000

D:\G09\H2O\H2O.wfn

[ Last edited by zhou2009 on 2012-6-22 at 08:56 ]
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6楼2012-06-22 08:43:07
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by loovfnd at 2012-06-21 21:56:56
multiwfn是免费的吗？...

multiwfn是免费的：

http://multiwfn.codeplex.com
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7楼2012-06-22 08:45:30
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wuhen116

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhou2009 at 2012-06-22 08:43:07
H2O的算例：

# HF/6-311++G** POP=FULL  output=wfn   

H2O

0,1
8        0.000000    0.113059    0.000000
1        0.752685   -0.452252    0.000000
1       -0.752685   -0.452220    0.00 ...

十分感谢你耐心的解答！thank you very much！
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8楼2012-06-22 10:18:37
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liujiangping

新虫 (初入文坛)
你好，能否提供一些关于关于氢氘的热力学性质的文献，急啊，求到了，所有金币给你啊。
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9楼2012-06-24 22:55:20
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wuhen116

木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by liujiangping at 2012-06-24 22:55:20
你好，能否提供一些关于关于氢氘的热力学性质的文献，急啊，求到了，所有金币给你啊。

你好，首先我很奇怪你为什么会在这里求文献？其次就是你这范围给的太宽，别人也没法应助你。想求助文献最好能把具体的信息给出来，否则大家很难帮你。
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10楼2012-06-25 09:53:28
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