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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO.错误
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kaegi

金虫 (小有名气)

[求助] Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO.错误

我做一分子动力学模拟的作业，输入文件如下
%mem=8GB
%nprocshared=8
#p uff admp=(stepsize=2000,maxpoints=50)

opt

0 1
C                 -3.29066264   -0.09035370   -0.00118279
H                 -2.75749889   -1.01805862   -0.00118279
H                 -4.36066264   -0.09035370   -0.00118279
C                 -2.61538833    1.08462360   -0.00118279
H                 -3.14855207    2.01232852   -0.00118279
C                 -1.07538833    1.08462360   -0.00118279
H                 -0.54222458    1.70730215    0.68650016
C                 -0.39314493    0.29868186   -0.86917275
H                  0.62253821    0.03291952   -0.66263427
C                 -1.07467532   -0.21324751   -2.15176569
H                 -0.98893531   -1.24391825   -2.42611303
C                 -1.78264268    0.63716208   -2.93416763
H                 -2.78904276    0.40247595   -3.21162268
C                 -1.13646954    1.94580073   -3.42561971
H                 -1.75482230    2.76076281   -3.73927030
C                  0.21264455    2.06876172   -3.46220936
H                  0.68349045    2.95206144   -3.08407480
C                  1.07100880    0.93330175   -4.05003711
H                  1.97863923    0.64405219   -3.56275722
C                  0.68076278    0.29918632   -5.18236776
H                 -0.22586389    0.58401219   -5.67410175
H                  1.28133147   -0.48901153   -5.58605253

最后显示错误为
Number         701        989        993        997        998
Base         89271      46842      66842      67042      67512
End         100194      66842      67042      67512      67712
End1        100194      66842      67042      67512      67712
Wr Pntr     100194      66842      67042      67512      67712
Rd Pntr      89271      46842      66842      67042      67512
Length       10923      20000        200        470        200


dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles =     1 SizExt =    524288 WInBlk =       512
                   defal = T LstWrd =       65536 FType=2 FMxFil=10000

Number           0
Base         40448
End          65536
End1         65536
Wr Pntr      40448
Rd Pntr      40448
Length       25088
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.

查了一些帖子，有说是磁盘空间不够，我想应该不至于吧。有的说是chk文件找不到，我压根就没有需要读取chk嘛，所以应该也不是这种错误吧。求高手指点，以解我心中迷惑。相应的log在附件中。
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yaohy

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1楼2011-06-23 15:46:27
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kaegi

金虫 (小有名气)
我猜是不是我用分子力场方法计算，输入格式不对？应指定原子的杂化类型？
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2楼2011-06-23 15:58:33
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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 2011-06-23 17:04:59
你没有指定chk文件，在输入文件开头应该要加一行

%chk=abc

abc是你指定的文件名

无论你要不要从chk文件读东西，总要指定的...
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3楼2011-06-23 16:44:29
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kaegi

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by fatpig8832 at 2011-06-23 16:44:29:
你没有指定chk文件，在输入文件开头应该要加一行

%chk=abc

abc是你指定的文件名

无论你要不要从chk文件读东西，总要指定的...

%chk=cis-cis-uff
%mem=8GB
%nprocshared=8
#p uff admp=(stepsize=2000,maxpoints=2000)

opt

0 1
C-C_R             -3.29066264   -0.09035370   -0.00118279
H-H_              -2.75749889   -1.01805862   -0.00118279
H-H_              -4.36066264   -0.09035370   -0.00118279
C-C_R             -2.61538833    1.08462360   -0.00118279
H-H_              -3.14855207    2.01232852   -0.00118279
C-C_R             -1.07538833    1.08462360   -0.00118279
H-H_              -0.54222458    1.70730215    0.68650016
C-C_R             -0.39314493    0.29868186   -0.86917275
H-H_               0.62253821    0.03291952   -0.66263427
C-C_R             -1.07467532   -0.21324751   -2.15176569
H-H_              -0.98893531   -1.24391825   -2.42611303
C-C_R             -1.78264268    0.63716208   -2.93416763
H-H_              -2.78904276    0.40247595   -3.21162268
C-C_R             -1.13646954    1.94580073   -3.42561971
H-H_              -1.75482230    2.76076281   -3.73927030
C-C_R              0.21264455    2.06876172   -3.46220936
H-H_               0.68349045    2.95206144   -3.08407480
C-C_R              1.07100880    0.93330175   -4.05003711
H-H_               1.97863923    0.64405219   -3.56275722
C-C_R              0.68076278    0.29918632   -5.18236776
H-H_              -0.22586389    0.58401219   -5.67410175
H-H_               1.28133147   -0.48901153   -5.58605253

输入文件改为如上，错误还是一样的。。。
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4楼2011-06-23 19:14:23
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独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-06-23 20:54:28
kaegi(金币+10): 2011-06-23 20:56:24
把uff换成int=am1就能算下去，我只能说这可能与方法有关，你可以查一下uff具体的用法和admp的用法，至于那个错误只知道与文件读写出错有关，这方面我也不懂还是等待高手或者靠你自己了
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轮回的过往，注定的未来；独孤的行者，孤独的路途……
5楼2011-06-23 20:47:25
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yaohy

新虫 (小有名气)
送红花一朵
您好，我也遇到了跟您类似的问题，能不能说一下您是怎么解决的呢？虽然帖子时间有点长了，但是如果记得的话，还麻烦您帮帮忙！谢谢！
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6楼2016-01-19 09:55:17
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kaegi

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by yaohy at 2016-01-19 09:55:17
您好，我也遇到了跟您类似的问题，能不能说一下您是怎么解决的呢？虽然帖子时间有点长了，但是如果记得的话，还麻烦您帮帮忙！谢谢！

你好，这个问题后来我就没有研究了，实在不记得最后是什么情况。建议你先试试前面一些答复的方案
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7楼2016-03-02 08:54:03
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