24小时热门版块排行榜    

查看: 3080  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

kaegi

金虫 (小有名气)

[求助] Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO.错误

我做一分子动力学模拟的作业,输入文件如下
%mem=8GB
%nprocshared=8
#p uff admp=(stepsize=2000,maxpoints=50)

opt

0 1
C                 -3.29066264   -0.09035370   -0.00118279
H                 -2.75749889   -1.01805862   -0.00118279
H                 -4.36066264   -0.09035370   -0.00118279
C                 -2.61538833    1.08462360   -0.00118279
H                 -3.14855207    2.01232852   -0.00118279
C                 -1.07538833    1.08462360   -0.00118279
H                 -0.54222458    1.70730215    0.68650016
C                 -0.39314493    0.29868186   -0.86917275
H                  0.62253821    0.03291952   -0.66263427
C                 -1.07467532   -0.21324751   -2.15176569
H                 -0.98893531   -1.24391825   -2.42611303
C                 -1.78264268    0.63716208   -2.93416763
H                 -2.78904276    0.40247595   -3.21162268
C                 -1.13646954    1.94580073   -3.42561971
H                 -1.75482230    2.76076281   -3.73927030
C                  0.21264455    2.06876172   -3.46220936
H                  0.68349045    2.95206144   -3.08407480
C                  1.07100880    0.93330175   -4.05003711
H                  1.97863923    0.64405219   -3.56275722
C                  0.68076278    0.29918632   -5.18236776
H                 -0.22586389    0.58401219   -5.67410175
H                  1.28133147   -0.48901153   -5.58605253

最后显示错误为
Number         701        989        993        997        998
Base         89271      46842      66842      67042      67512
End         100194      66842      67042      67512      67712
End1        100194      66842      67042      67512      67712
Wr Pntr     100194      66842      67042      67512      67712
Rd Pntr      89271      46842      66842      67042      67512
Length       10923      20000        200        470        200


dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles =     1 SizExt =    524288 WInBlk =       512
                   defal = T LstWrd =       65536 FType=2 FMxFil=10000

Number           0
Base         40448
End          65536
End1         65536
Wr Pntr      40448
Rd Pntr      40448
Length       25088
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.

查了一些帖子,有说是磁盘空间不够,我想应该不至于吧。有的说是chk文件找不到,我压根就没有需要读取chk嘛,所以应该也不是这种错误吧。求高手指点,以解我心中迷惑。相应的log在附件中。
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-06-23 20:54:28
kaegi(金币+10): 2011-06-23 20:56:24
把uff换成int=am1就能算下去,我只能说这可能与方法有关,你可以查一下uff具体的用法和admp的用法,至于那个错误只知道与文件读写出错有关,这方面我也不懂还是等待高手或者靠你自己了
轮回的过往,注定的未来;独孤的行者,孤独的路途……
5楼2011-06-23 20:47:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

kaegi

金虫 (小有名气)

我猜是不是我用分子力场方法计算,输入格式不对?应指定原子的杂化类型?
2楼2011-06-23 15:58:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 2011-06-23 17:04:59
你没有指定chk文件,在输入文件开头应该要加一行

%chk=abc

abc是你指定的文件名

无论你要不要从chk文件读东西,总要指定的...
3楼2011-06-23 16:44:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kaegi

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by fatpig8832 at 2011-06-23 16:44:29:
你没有指定chk文件,在输入文件开头应该要加一行

%chk=abc

abc是你指定的文件名

无论你要不要从chk文件读东西,总要指定的...

%chk=cis-cis-uff
%mem=8GB
%nprocshared=8
#p uff admp=(stepsize=2000,maxpoints=2000)

opt

0 1
C-C_R             -3.29066264   -0.09035370   -0.00118279
H-H_              -2.75749889   -1.01805862   -0.00118279
H-H_              -4.36066264   -0.09035370   -0.00118279
C-C_R             -2.61538833    1.08462360   -0.00118279
H-H_              -3.14855207    2.01232852   -0.00118279
C-C_R             -1.07538833    1.08462360   -0.00118279
H-H_              -0.54222458    1.70730215    0.68650016
C-C_R             -0.39314493    0.29868186   -0.86917275
H-H_               0.62253821    0.03291952   -0.66263427
C-C_R             -1.07467532   -0.21324751   -2.15176569
H-H_              -0.98893531   -1.24391825   -2.42611303
C-C_R             -1.78264268    0.63716208   -2.93416763
H-H_              -2.78904276    0.40247595   -3.21162268
C-C_R             -1.13646954    1.94580073   -3.42561971
H-H_              -1.75482230    2.76076281   -3.73927030
C-C_R              0.21264455    2.06876172   -3.46220936
H-H_               0.68349045    2.95206144   -3.08407480
C-C_R              1.07100880    0.93330175   -4.05003711
H-H_               1.97863923    0.64405219   -3.56275722
C-C_R              0.68076278    0.29918632   -5.18236776
H-H_              -0.22586389    0.58401219   -5.67410175
H-H_               1.28133147   -0.48901153   -5.58605253

输入文件改为如上,错误还是一样的。。。
4楼2011-06-23 19:14:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +9 一鸭鸭哟 2026-03-14 11/550 2026-03-19 17:22 by !本暗一次!
[考研] 招收调剂硕士 +4 lidianxing 2026-03-19 10/500 2026-03-19 16:05 by 余麟余
[考研] 求调剂,一志愿:南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕,总分289分 +3 @taotao 2026-03-19 3/150 2026-03-19 14:07 by peike
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 一志愿中海洋材料工程专硕330分求调剂 +7 小材化本科 2026-03-18 7/350 2026-03-19 10:46 by Linda Hu
[考研] 一志愿天大材料与化工(085600)总分338 +5 蔡大美女 2026-03-13 5/250 2026-03-19 10:44 by 是小刘呀~
[考研] 0703化学 305求调剂 +4 FY_yy 2026-03-14 4/200 2026-03-19 05:54 by anny19840123
[考研] 材料工程专硕调剂 +5 204818@lcx 2026-03-17 6/300 2026-03-18 22:55 by 204818@lcx
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-17 7/350 2026-03-18 20:41 by Wangjingyue
[考研] 070300化学319求调剂 +6 锦鲤0909 2026-03-17 6/300 2026-03-18 13:22 by Iveryant
[考研] 312求调剂 +8 陌宸希 2026-03-16 9/450 2026-03-18 12:39 by Linda Hu
[考研] 304求调剂 +12 小熊joy 2026-03-14 13/650 2026-03-18 12:34 by Linda Hu
[考研] 考研求调剂 +3 橘颂. 2026-03-17 4/200 2026-03-17 21:43 by 有只狸奴
[考研] 301求调剂 +4 A_JiXing 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:32 by ruiyingmiao
[考研] 332求调剂 +6 Zz版 2026-03-13 6/300 2026-03-17 17:03 by ruiyingmiao
[考研] 26考研求调剂 +6 丶宏Sir 2026-03-13 6/300 2026-03-17 16:13 by 醉在风里
[考研] 0703化学调剂 290分有科研经历,论文在投 +7 腻腻gk 2026-03-14 7/350 2026-03-16 10:12 by houyaoxu
[考研] 080500,材料学硕302分求调剂学校 +4 初识可乐 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:08 by peike
[考研] [0860]321分求调剂,ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 311求调剂 +3 冬十三 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:41 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见