24小时热门版块排行榜    

查看: 3364  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

kaegi

金虫 (小有名气)

[求助] Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO.错误

我做一分子动力学模拟的作业,输入文件如下
%mem=8GB
%nprocshared=8
#p uff admp=(stepsize=2000,maxpoints=50)

opt

0 1
C                 -3.29066264   -0.09035370   -0.00118279
H                 -2.75749889   -1.01805862   -0.00118279
H                 -4.36066264   -0.09035370   -0.00118279
C                 -2.61538833    1.08462360   -0.00118279
H                 -3.14855207    2.01232852   -0.00118279
C                 -1.07538833    1.08462360   -0.00118279
H                 -0.54222458    1.70730215    0.68650016
C                 -0.39314493    0.29868186   -0.86917275
H                  0.62253821    0.03291952   -0.66263427
C                 -1.07467532   -0.21324751   -2.15176569
H                 -0.98893531   -1.24391825   -2.42611303
C                 -1.78264268    0.63716208   -2.93416763
H                 -2.78904276    0.40247595   -3.21162268
C                 -1.13646954    1.94580073   -3.42561971
H                 -1.75482230    2.76076281   -3.73927030
C                  0.21264455    2.06876172   -3.46220936
H                  0.68349045    2.95206144   -3.08407480
C                  1.07100880    0.93330175   -4.05003711
H                  1.97863923    0.64405219   -3.56275722
C                  0.68076278    0.29918632   -5.18236776
H                 -0.22586389    0.58401219   -5.67410175
H                  1.28133147   -0.48901153   -5.58605253

最后显示错误为
Number         701        989        993        997        998
Base         89271      46842      66842      67042      67512
End         100194      66842      67042      67512      67712
End1        100194      66842      67042      67512      67712
Wr Pntr     100194      66842      67042      67512      67712
Rd Pntr      89271      46842      66842      67042      67512
Length       10923      20000        200        470        200


dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles =     1 SizExt =    524288 WInBlk =       512
                   defal = T LstWrd =       65536 FType=2 FMxFil=10000

Number           0
Base         40448
End          65536
End1         65536
Wr Pntr      40448
Rd Pntr      40448
Length       25088
Error termination in NtrErr:
NtrErr Called from FileIO.

查了一些帖子,有说是磁盘空间不够,我想应该不至于吧。有的说是chk文件找不到,我压根就没有需要读取chk嘛,所以应该也不是这种错误吧。求高手指点,以解我心中迷惑。相应的log在附件中。
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 2011-06-23 17:04:59
你没有指定chk文件,在输入文件开头应该要加一行

%chk=abc

abc是你指定的文件名

无论你要不要从chk文件读东西,总要指定的...
3楼2011-06-23 16:44:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

kaegi

金虫 (小有名气)

我猜是不是我用分子力场方法计算,输入格式不对?应指定原子的杂化类型?
2楼2011-06-23 15:58:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kaegi

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by fatpig8832 at 2011-06-23 16:44:29:
你没有指定chk文件,在输入文件开头应该要加一行

%chk=abc

abc是你指定的文件名

无论你要不要从chk文件读东西,总要指定的...

%chk=cis-cis-uff
%mem=8GB
%nprocshared=8
#p uff admp=(stepsize=2000,maxpoints=2000)

opt

0 1
C-C_R             -3.29066264   -0.09035370   -0.00118279
H-H_              -2.75749889   -1.01805862   -0.00118279
H-H_              -4.36066264   -0.09035370   -0.00118279
C-C_R             -2.61538833    1.08462360   -0.00118279
H-H_              -3.14855207    2.01232852   -0.00118279
C-C_R             -1.07538833    1.08462360   -0.00118279
H-H_              -0.54222458    1.70730215    0.68650016
C-C_R             -0.39314493    0.29868186   -0.86917275
H-H_               0.62253821    0.03291952   -0.66263427
C-C_R             -1.07467532   -0.21324751   -2.15176569
H-H_              -0.98893531   -1.24391825   -2.42611303
C-C_R             -1.78264268    0.63716208   -2.93416763
H-H_              -2.78904276    0.40247595   -3.21162268
C-C_R             -1.13646954    1.94580073   -3.42561971
H-H_              -1.75482230    2.76076281   -3.73927030
C-C_R              0.21264455    2.06876172   -3.46220936
H-H_               0.68349045    2.95206144   -3.08407480
C-C_R              1.07100880    0.93330175   -4.05003711
H-H_               1.97863923    0.64405219   -3.56275722
C-C_R              0.68076278    0.29918632   -5.18236776
H-H_              -0.22586389    0.58401219   -5.67410175
H-H_               1.28133147   -0.48901153   -5.58605253

输入文件改为如上,错误还是一样的。。。
4楼2011-06-23 19:14:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-06-23 20:54:28
kaegi(金币+10): 2011-06-23 20:56:24
把uff换成int=am1就能算下去,我只能说这可能与方法有关,你可以查一下uff具体的用法和admp的用法,至于那个错误只知道与文件读写出错有关,这方面我也不懂还是等待高手或者靠你自己了
轮回的过往,注定的未来;独孤的行者,孤独的路途……
5楼2011-06-23 20:47:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 4/200 2026-09-27 06:44 by XgCC8uTcwILl
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 4/200 2026-09-27 06:42 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 4/200 2026-09-27 06:39 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:32 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:08 by XgCC8uTcwILl
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:05 by XgCC8uTcwILl
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:56 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:56 by XgCC8uTcwILl
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 05:56 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 5/250 2026-09-27 05:53 by XgCC8uTcwILl
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:50 by XgCC8uTcwILl
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 5/250 2026-09-27 05:44 by XgCC8uTcwILl
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 05:44 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 6/300 2026-09-27 05:42 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 PGTSwSC3F6nQ 2026-09-24 5/250 2026-09-25 11:19 by yhq9807
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 PGTSwSC3F6nQ 2026-09-24 7/350 2026-09-25 11:18 by yhq9807
[硕博家园] 上海工程技术大学 激光智能制造课题组 2027级博士研究生招生 +4 oxidpl 2026-09-20 6/300 2026-09-24 20:40 by oxidpl
[教师之家] 课题组招2027级博士 上海工程技术大学 激光智能制造方向 +4 oxidpl 2026-09-20 6/300 2026-09-24 20:37 by oxidpl
[基金申请] 师弟论文见刊大半年才想起来申请专利,还能抢救一下吗? +4 13108017953 2026-09-21 4/200 2026-09-24 10:06 by kudofaye
[有机交流] 有机合成以后会不会被AI改变?做科研的虫友怎么看 +5 zapen 2026-09-20 8/400 2026-09-23 17:21 by tianxiaoxian
信息提示
请填处理意见