| 查看: 3401 | 回复: 7 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
rainandstar银虫 (小有名气)
|
[求助]
G09集群计算结果的chk文件转换问题
|
|
|
各位好，我用的是系里的集群服务器，在Linux上进行G09计算的。现在我想看一下一个结构的electrostatic potential surface，这个应该在Gview中查看chk文件才能实现。我已得到chk文件，但是查了手册才发现，在自己的电脑（windows）上，还要在转换为fchk文件才行。 我根据手册和版上几个帖子中提到的方法进行了尝试，结果失败了，下面是我的过程，有经验的同学请帮忙看看问题出在什么地方，应该怎么解决。谢谢 1，我首先尝试SSH远程登录到cluster上直接实现，具体为进入完成该任务的lanth，进入其中g09的目录，输入formchk /home/name/**.chk /home/name/**fchk，给出的提示是command not found。 2，我把得到的chk文件下到自己的电脑上，然后用g9w中的formchk时也不能转换格式，显示为： Bad file opened by FileIO: Unit=2 I= 2 FPrev=40960 FCur= 0. FileIO: IOper= 9 IFileNo<1>= 2 Len= 0 IPos= 0 Q= 4573204 Error termination in NtrErr: NtrErr called from FileIO. 不知道这个是什么原因。 3，接着上面的情况，我直接把chk文件复制到\g09w\scratch中，然后运行formchk c:\g09w\scratch\**.chk c:\g09w\scratch\**fchk，屏幕显示为： fname=c:\g09w\scratch\**.chk fd = -1 fname=c:\g09w\scratch\**.chk fd = -1 open-new-file open-new-file:Invalid argument 总结下来，感觉在SSH上远程用Linux或者在自己电脑上有G09 windows应该都是可以的，但是我不知道哪里的命令写的不对。恩，就是这样了，请多指教。thanks |
回复此楼» 猜你喜欢
26年材料/化学相关专业博士研究生招生 温州大学化学与材料工程学院(26年秋季入学)
已经有0人回复
-
温州大学新能源材料微观溯源课题组招收2026级博士研究生（材料、化学方向）
已经有6人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有203人回复
-
哈尔滨工业大学（深圳）绿色化学团队招收2026年秋季入学博士生
已经有11人回复
-
材料与化工 323 英一+数二+物化，一志愿：哈工大 本人本科双一流
已经有5人回复
-
26申博
已经有2人回复
-
澳大利亚昆士兰科技大学PhD博士奖学金
已经有0人回复
-
求助电催化剂制备，怎么在碳布表面生长PdCo合金
已经有0人回复
-
求助电催化剂制备，怎么在碳布表面生长PdCo合金
已经有0人回复
-
304求调剂
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 已经计算完成的chk文件还能使用SSH进行chk到fchk的转换吗
已经有9人回复
- 集群和进程的问题
已经有3人回复
- 用高斯09计算保存的chk文件，打不开，怎么回事？
已经有4人回复
- formchk转换chk后只得到文件大小为0的fchk，求解
已经有3人回复
- 急求.chk文件转formchk文件方法
已经有6人回复
- 计算化学便面势能怎么在CHK文件里看
已经有8人回复
- 【求助】【已完结】G09计算单重三重激发态结果分析
已经有19人回复
- 从Chk到 fchk文件转换的命令行
已经有5人回复
- g09linux与g03w计算效率对比
已经有13人回复
- Gaussian 09 计算出来的chk文件无法转化成fchk文件，求高手指教！
已经有9人回复
- 怎么用gaussview5.0.9打开g03算的chk文件
已经有9人回复
- 如何在计算机群上安装G09
已经有9人回复
- hydrophobic index是什么，如何计算？谢谢
已经有4人回复
- 在linux系统下 打不开chk文件
已经有6人回复
- G09中计算AIM计算过渡金属原子和氢原子间作用的问题
已经有7人回复
- g09计算终止，没有错误信息
已经有5人回复
- Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO.错误
已经有6人回复
- Linux组建计算化学集群的教程
已经有54人回复
- gaussian 激发态优化后的chk文件和荧光计算后的chk文件有何不同
已经有5人回复
- 【求助】用gaussian计算得到out文件和chk文件，怎么得到fch文件？
已经有4人回复
- 【求助】我的CHK文件不见了。。。。
已经有4人回复
- 【求助】计算错误 帮忙看看
已经有6人回复
- 【求助】关于g09和g03的formchk和unfchk问题
已经有11人回复
- 【求助】chk文件转换
已经有18人回复
yoyo103108
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 483.5
- 帖子: 80
- 在线: 48小时
- 虫号: 1190996
- 注册: 2011-01-17
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
5楼2014-07-08 10:50:06
xj544
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3649.3
- 散金: 20
- 红花: 1
- 帖子: 152
- 在线: 84.7小时
- 虫号: 945655
- 注册: 2010-01-20
- 专业: 理论和计算化学
2楼2011-09-02 15:06:52
xj544
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3649.3
- 散金: 20
- 红花: 1
- 帖子: 152
- 在线: 84.7小时
- 虫号: 945655
- 注册: 2010-01-20
- 专业: 理论和计算化学
C-Young3楼2011-09-02 15:07:39
yuanzou3015
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 350.5
- 红花: 1
- 帖子: 54
- 在线: 69.5小时
- 虫号: 94057
- 注册: 2005-09-25
- 专业: 理论和计算化学
4楼2011-11-01 16:09:39
50