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呼呼xinong

铁虫 (初入文坛)

[交流] 3'RACE测序结果求助 已有10人参与

本人现在做3race,测序结果存在一种现象,不知各位大侠遇到过没?在此求揭示!本人按照clontech的试剂盒做的结果,pcr,切胶回收,连接后转化,挑单克隆跑pcr,检查到目的条带后每个基因送测10个菌。测序结果都是我要的基因,但是相同基因不同菌落的序列之间存在差异,即在靠近polyA处,序列长短不一,也就是说3’UTR序列长短不一,但是前提条件是短的序列测序结果也含有polyA。请问这是什么现象?如何选择序列?
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hihe99

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我也遇到这个问题,请问楼上都怎么解决的,这个现象很普遍吗?
11楼2014-12-10 19:16:33
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hihe99

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by 音四1990 at 2014-03-09 17:57:46
我还没到测序那一步……不过老师之前跟我说的 在克隆时菌落大小和PCR产物大小有一定关系= =
我也不知为毛
不同菌落的测序结果确实会有差异 所以RACE一般要测多个克隆
老师说一些小片段测出来会“很有意思” 我还 ...

你给楼主的加油可能晚了吧,11年发的帖子
不过不知道,过了几个月你参透你老师的话没。另外,我也遇到楼主一样的问题了,不知道怎么解决啊。
12楼2014-12-10 19:19:31
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