版块导航: 正在加载中...

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

返回列表

gtssongchi

木虫 (小有名气)

应助: 3 (幼儿园)
金币: 4373.1
散金: 136
红花: 2
帖子: 157
在线: 99.5小时
虫号: 1137504
注册: 2010-11-02
性别: GG
专业: 凝聚态物性 II ：电子结构

[求助] siesta运行MD遇到的问题

siesta运行MD模拟液态体系，采用了NVT(nose)系综，已经运行了10000多步，可是温度仍然有很大震荡，似乎没有平衡，我想问：
1、有没有可能是其他原因造成的呢？
2、我的温度是在标准输出文件(.out)中每一个MDstep下的那个siesta: Temp_ion = 843.958 K，不知是否应观察这个温度？
3、温度的震荡是否跟我体系的大小有关系，有一个标签是MD.Nosemass，我一直是用默认值，不知道是否需要改动这个量？

回复此楼

» 猜你喜欢

售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急已经有4人回复
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急已经有4人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急已经有4人回复
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急已经有5人回复
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急已经有5人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急已经有5人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急已经有5人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急已经有5人回复
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急已经有4人回复
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急已经有4人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

NWchem编译出错已经有6人回复
siesta运行出现问题，Error in Cholesky factorisation in cdiag，原子间距过小，求助已经有5人回复
siesta提交任务出现错误已经有8人回复
各路英雄请注意。强势推出重磅问题：ScaLAPACK 和LAPACK的差别？已经有4人回复
siesta计算出现forrtl: error (69): process interrupted (SIGINT) 已经有10人回复
AMBER11+AmberTool1.5安装出错（显卡型号GTX680）已经有6人回复
用第一性原理MD，使用Siesta的原子数能到多少？已经有8人回复
在gromacs中运行mdrun命令时出错已经有10人回复
siesta 3.1 画电荷密度图已经有4人回复
VASP 运行MD的相关问题已经有8人回复
原来编译的siesta突然不能用，重新编译没错，运行出错已经有13人回复
请教，为什么siesta编译中没报错，然而运行的时候跑不起来呢已经有9人回复
siesta运行出错！！！已经有3人回复
还是SIESTA安装的问题已经有9人回复
【求助】siesta 安装出错已经有18人回复
【求助】mdrun 之后出现segmentation fault 怎么解决？已经有6人回复
【求助】用siesta计算出现的问题已经有3人回复
【求助】求助解决用mpich2.1 编译siesta，计算出现错误，已经有12人回复
【求助】ms模拟c纳米管问题已经有17人回复

1楼 2011-08-26 12:09:05

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

dalongmao

木虫 (正式写手)

应助: 3 (幼儿园)
金币: 4363.4
散金: 6
红花: 2
帖子: 613
在线: 448.9小时
虫号: 596465
注册: 2008-09-09
专业: 理论和计算化学

★
zzy870720z(金币+1): 谢谢建议 2011-09-07 09:27:52

建议去siesta-mail系统里面问问

赞一下(1人)

回复此楼

2楼2011-09-06 21:36:05

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

相关版块跳转我要订阅楼主 gtssongchi 的主题更新

返回列表

最具人气热帖推荐 [查看全部]		作者	回/看	最后发表

[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3	BMTdnp4OJO9f 2026-11-06	5/250	2026-11-07 17:56 by Xc2FxHsHkBNc
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3	BMTdnp4OJO9f 2026-11-06	5/250	2026-11-07 17:45 by Xc2FxHsHkBNc
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4	2rKfVQg2jQww 2026-11-06	5/250	2026-11-07 17:23 by Xc2FxHsHkBNc
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3	5sJFDKp2kwuI 2026-11-06	4/200	2026-11-07 16:28 by Xc2FxHsHkBNc
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3	5sJFDKp2kwuI 2026-11-06	5/250	2026-11-07 16:06 by Xc2FxHsHkBNc
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8	ncTVBM6AOJHF 2026-11-04	23/1150	2026-11-07 06:49 by Equinoxhua
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4	ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05	5/250	2026-11-06 16:43 by 5sJFDKp2kwuI
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +6	ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05	8/400	2026-11-06 16:34 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6	ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04	11/550	2026-11-06 16:32 by 5sJFDKp2kwuI
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +7	ncTVBM6AOJHF 2026-11-04	14/700	2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8	ncTVBM6AOJHF 2026-11-04	12/600	2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +8	ncTVBM6AOJHF 2026-11-04	18/900	2026-11-06 13:36 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5	ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05	10/500	2026-11-06 12:32 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3	ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05	5/250	2026-11-06 09:01 by 2lRNluKrJpwL
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5	kvewwGtKktqB 2026-11-04	14/700	2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4	ttH3f1oA6ace 2026-11-04	7/350	2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4	ttH3f1oA6ace 2026-11-04	10/500	2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4	hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04	12/600	2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4	ncTVBM6AOJHF 2026-11-04	12/600	2026-11-05 11:10 by PYZmcHr5kSaq
[基金申请] 各位基础老师们，看完中央《从严治党》的决定后，对学术界更加有信心了吧 +5	iaeyuan 2026-11-01	5/250	2026-11-04 14:43 by jinchengzi