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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 专业学科区 » 农林 » 农林综合 » 求助关于ssr标记连锁图谱构建问题
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yzmaize

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助关于ssr标记连锁图谱构建问题

最近在做构建连锁图谱，发现有的标记无法构入图谱，有什么方法可以尽量多的构入多的标记，求助，急急~~~~~~
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1楼 2011-08-24 15:30:44
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zzczxl

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
木虫/panda(金币+1): 鼓励应助，欢迎常来农林版 2011-08-28 14:31:43
yzmaize(金币+3): 2011-09-11 11:56:07
首先，你查看一下你那些无法构入的标记的物理位置，与最近的标记之间是否有较大的gap，如果这样，你要加密分子标记。另外，你的群体也要检测一下，是否符合正态分布。祝你成功。
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6楼2011-08-28 11:55:54
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根
★ ★
缺友情(金币+2): 鼓励应助交流！欢迎常来农林版！ 2011-08-24 17:45:47
一般说来总有一些连不上。
我得先了解一下：总共多少个连锁群？有多少标记连不到一块？有没有发表过的参照图谱？存在不存在偏分离现象？
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真相是最大的奢侈品
2楼2011-08-24 15:59:34
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根
用的是Mapmarker V2.0建的？
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真相是最大的奢侈品
3楼2011-08-24 16:01:51
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yunbfly

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
木虫/panda(金币+1): 鼓励应助，欢迎常来农林版 2011-08-28 14:31:32
那段区域的分子标记数据太少和数据错误都会导致某些标记不能进入连锁群。对付这些标记，只能先检查有没有数据错误。若无错误，通过比对参考图谱，查找该标记区域的新标记，或者设计一些标记，集中添加该区域的标记。
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5楼2011-08-25 16:07:17
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