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笨笨达达

银虫 (小有名气)

[求助] 求助 序列比对~~~~

测序后,与GenBank比对,相似度只有87%,表现为100bp往后都一样,1-48bp相似,中间不相同。我是鉴定真菌的,形态学上确实是那种菌,请问各位大侠,是什么原因呢?与引物有关么?
怎么解决么?
有引物是ITS1 (5'-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3')
              ITS4 (5'-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3')


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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

笨笨达达(金币+15): 金币都给你啦~谢谢啦~ 2011-08-15 22:25:58
楼主看过测序图谱了吗?
jiayoubashaonian
4楼2011-08-15 13:11:22
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查看全部 7 个回答

笨笨达达

银虫 (小有名气)

自己顶一个,坐等高人啊~~~
2楼2011-08-15 09:22:44
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hailiang1029

金虫 (正式写手)

★ ★
西瓜(金币+2): 鼓励交流 2011-08-16 00:34:34
Gene Bank不一定准确啊,也是别人上传的,这个菌有没有其他的类似的种类?你最好是把已经确认的阳性样品测序,然后拿位置样品来与之对比,这样准确。
5楼2011-08-15 13:40:23
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笨笨达达

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-08-15 13:11:22:
楼主看过测序图谱了吗?

看过了啊,没问题的~~~是什么原因呢
6楼2011-08-15 14:26:45
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