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muchong5577

金虫 (正式写手)

[求助] 做RT-PCR的战友们,内标定量怎么做?

从来没做过内标定量的荧光定量PCR,有战友做过这个没?内标定量有什么优点?具体怎么做?初次接触,望大家帮我解答这些疑问。告诉我这方面的文献资料也行。谢谢了!
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muchong5577

金虫 (正式写手)

期待高手的帮助
2楼2011-08-09 16:09:59
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adslye

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
muchong5577(金币+5): 非常感谢! 2011-08-10 09:42:41
lstt09nk(金币+5, BioEPI+1): 我也要做这个,感谢分享~~ 2011-08-11 13:06:15
1.内标定量?是指的内参吧?reference gene ?是这个吗?
2.real-time 定量有三种:标准曲线法,双标准曲线法,DELTA DELTA CT法。(PS.没有楼主说的内标定量法)
   标准曲线法:是精确定量,知道具体的表达数,一般应用于医院检测病毒携带数(乙肝病毒数)。
   后面两者是相对定量,知道A和B之间的关系,比如:A是B的多少倍。用于处理组和非处理组之间的基因表达差异。
一般认为绝对定量可以不用内参,相对定量使用内参。
3.具体操作过程。个人感觉楼主初次接触,还是看些资料吧。
生物秀这个栏目还可以http://ask.bbioo.com/special/experiment/RealtimePCR.htm
推荐这本书《Real-time PCR》  网上有下,我就不上传了。
3楼2011-08-09 16:39:41
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missoulmate

金虫 (小有名气)

RT-PCR 是反转录PCR
楼主说的应该是RealTime-PCR吧
根据内参和你做的引物得到一个标曲,然后再做后面的。
4楼2011-08-09 22:57:43
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muchong5577

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by adslye at 2011-08-09 16:39:41:
1.内标定量?是指的内参吧?reference gene ?是这个吗?
2.real-time 定量有三种:标准曲线法,双标准曲线法,DELTA DELTA CT法。(PS.没有楼主说的内标定量法)
   标准曲线法:是精确定量,知道具体的表达数 ...

我是想,在RealTime-PCR中有内标,能不能这样:使内标既能当传统的内标使用,监测假阳性、体系中有无抑制剂等;另外,内标又能做定量的标准品,既与绝对定量中已知浓度的A、B、C、D一样的作用。
5楼2011-08-10 09:47:30
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adslye

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


muchong5577(金币+2): 2011-08-12 08:44:43
引用回帖:
5楼: Originally posted by muchong5577 at 2011-08-10 09:47:30:
我是想,在RealTime-PCR中有内标,能不能这样:使内标既能当传统的内标使用,监测假阳性、体系中有无抑制剂等;另外,内标又能做定量的标准品,既与绝对定量中已知浓度的A、B、C、D一样的作用。

1.您的实验目的是什么?是绝对定量还是相对定量?
2.我说的内参是基因,是引物。感觉您的内标是模板。我理解的对吗?
3.如果您要做绝对定量,绝对定量中已知浓度的样本是什么都可以,只要干净,浓度准确即可。

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6楼2011-08-10 10:18:37
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muchong5577

金虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by adslye at 2011-08-10 10:18:37:
1.您的实验目的是什么?是绝对定量还是相对定量?
2.我说的内参是基因,是引物。感觉您的内标是模板。我理解的对吗?
3.如果您要做绝对定量,绝对定量中已知浓度的样本是什么都可以,只要干净,浓度准确即可。

您好!谢谢您!
1. 我说的内标是人工合成的小片度基因,加上扩增这段基因的一对引物,其中一条引物有荧光标记;
2. 实验的目的是:不使用已知浓度的定量参考品ABCD,而使用内标定量样品中的模板DNA浓度,是绝对定量。
7楼2011-08-10 10:49:36
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silicare

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【答案】应助回帖

muchong5577(金币+2): 2011-08-12 08:45:02
引用回帖:
7楼: Originally posted by muchong5577 at 2011-08-10 10:49:36:
您好!谢谢您!
1. 我说的内标是人工合成的小片度基因,加上扩增这段基因的一对引物,其中一条引物有荧光标记;
2. 实验的目的是:不使用已知浓度的定量参考品ABCD,而使用内标定量样品中的模板DNA浓度,是绝对 ...

扩增效率是个主要问题
8楼2011-08-10 11:56:37
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adslye

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

muchong5577(金币+5): 谢谢您! 2011-08-11 10:59:44
引用回帖:
7楼: Originally posted by muchong5577 at 2011-08-10 10:49:36:
您好!谢谢您!
1. 我说的内标是人工合成的小片度基因,加上扩增这段基因的一对引物,其中一条引物有荧光标记;
2. 实验的目的是:不使用已知浓度的定量参考品ABCD,而使用内标定量样品中的模板DNA浓度,是绝对 ...

您好,绝对定量我没做过。但我在AB公司培训过,了解一点。
我记不清有哪种方法是一条引物带荧光来定量的。
目前就2种方法吧:探针和染料法。

不是太明白您的描述,以下为我猜测后的看法:
您是在研究新的方法?我觉得您的研究目对实际没有什么帮助。因为在定量上公司已经做得很成熟了。和公司比做方法学,难度不小额。

而且,弱弱地说一句,荧光定量PCR的应用受新技术挑战地位岌岌可危啊。
9楼2011-08-10 14:04:13
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adslye

银虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by silicare at 2011-08-10 11:56:37:
扩增效率是个主要问题

绝对定量扩增效率不需要考虑吧。因为在P标准品和样品的时候,引物是一样的。
10楼2011-08-10 14:05:31
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