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friya0910

新虫 (正式写手)

[交流] 质粒稳定性的问题 已有4人参与

目的片段转化连接后,挑单克隆摇菌,获得第一代菌,可是如果取第一代菌加入LB(含抗生素)再摇的话,连有目的片段的质粒会变吗?为什么我送的第一代菌液测序都挺正常的,可是第二代菌液测出来就好多不正常的呀?不是有碱基缺失就是根本找不到下游引物呢!从T载体上切目的片段,大家是不是都从第一代菌里提质粒切啊?还是可以一代一代的摇啊?
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

★ ★
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1949stone(金币+1): 鼓励 鼓励 2011-07-10 20:37:08
不可能总是用第一代的呀,我们都是一代一代的摇的,没你说的问题。
2楼2011-07-10 19:48:03
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空谷幽风

金虫 (正式写手)

★ ★
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1949stone(金币+1): 学习一下 2011-07-10 20:37:20
我们也遇到过相同的问题,有些质粒只在第一代菌里面是正确的,接种之后摇出来的菌全是错误的,解决的方法是多转几种不同的感受态细胞,找出能在里面稳定克隆的菌株。
a?,c??ae~?a,EURc§?c?μé-,cs,,a‘?é?“i1/4?i1/4?i1/4?i1/4?
3楼2011-07-10 19:50:05
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gwbk

木虫 (正式写手)

★ ★
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dhd997(金币+1): 有解决办法吗 2011-07-11 07:44:08
这个确实是一个问题,我也出现了这种问题,不过是在换载体后出现的,想起来挺郁闷的。
4楼2011-07-10 21:48:28
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gwbk

木虫 (正式写手)


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1949stone(EPI+1): 很好啊 学习了 2011-07-11 10:27:20
可能跟实验操作有关系,也可能跟宿主有关系,我的实验跟我的实验操作有关系,因为同样的宿主,有一株测序完全正确的。
有几点建议
1,切胶回收,凝胶拍照的时候,尽量减少紫外照射时间。我的突变是点是NNNGTTNNN,GT缺失,测序结果是NNNTNNN,怀疑跟嘧啶二聚体的形成有关。
2,实验操作该轻柔的一定不要剧烈。提质粒加NaOH时候,要求是轻摇5-8次,按照说明操作就行。

点突变可能是化学试剂、物理因素如紫外线、宿主对质粒的兼容性造成的,做实验的时候多注意点,找出自己突变的原因才是最关键的。
5楼2011-07-11 09:55:00
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足下客

木虫 (正式写手)


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重组质粒转入菌中,发生突变是非常常见的现象。目前,工业上用于大型发酵的菌株,大部分都是用第一代基因工程菌上罐,现在基因工程菌在很多行业都受到了限制,出于它的安全性考虑,非常不稳定 。
所以说要想避免质粒在后续的传代过程中不发生变化,是几乎不可能做到的。尽量不要向下传代太多次。一定要把原始的质粒保存好。
如果把质粒转到菌株中保存,在每次活化之后,最好是做验证,确认质粒没有发生变化。
6楼2011-07-11 13:24:31
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friya0910

新虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 足下客 at 2011-07-11 13:24:31:
重组质粒转入菌中,发生突变是非常常见的现象。目前,工业上用于大型发酵的菌株,大部分都是用第一代基因工程菌上罐,现在基因工程菌在很多行业都受到了限制,出于它的安全性考虑,非常不稳定 。
所以说要想避免 ...

每次活化以后还要测序验证,那岂不是很麻烦呢!
7楼2011-07-11 21:14:25
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gwbk

木虫 (正式写手)


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工业用菌一般保密性很强的,他们从来不送去测序哦~~
8楼2011-07-11 21:45:51
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gwbk

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
工业用菌确实存在很多问题,免不了质粒丢失严重,高突变等现象,但是一般工业用菌都是经过10代以上稳定筛选之后才用于小试、中试和工业生产的。菌体不稳定造可能成的损失巨大,所以鲜有工业用菌使用在2-3代菌就没有产量或者产量低的菌株。一般来说,一代菌用一点少一点,一代菌上罐太伤了,工业用菌一般会存储足够量的二代菌(多数是冷冻干燥安瓿管)用于生产,在生产中需要活化、制作摇瓶种子,如果菌体生长慢,还要进一步做种子罐,最后才能用于生产。如果菌体稳定性差,几代传下来,发酵的不稳定造成损失是很难估计的,而且一般不稳定菌都是先做小试、中试,成功后才能用于生产。

质粒在宿主中的稳定性确实需要进行筛选,实验中遇到的质粒突变能避免尽量避免,做好的质粒也不一定一直存放,由于不断的被用于各种改进实验,期间经过的大量筛选,避免了一代菌用完之后就没有更好的使用。使用高保真酶扩增、保证没有物理化学因素促变,使用合适的宿主,还是很容易得到没有突变的质粒的,后续连续传代培养也可以得到比较稳定的质粒的。
9楼2011-07-11 22:12:29
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