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gromacs的脚本运行错误
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PBS Job Id: 6693.cluster.hpc.org Job Name: GROMACS An error has occurred processing your job, see below. Post job file processing error; job 6693.cluster.hpc.org on host compute-0-4.local/3+compute-0-4.local/2+compute-0-4.local/1+compute-0-4.local/0Unknown resource type REJHOST=compute-0-4.local MSG=invalid home directory '/home/public' specified, errno=2 (No such file or directory) 脚本内容为： #!/bin/bash #PBS -N GROMACS #PBS -o gromacs.out #PBS -j oe #PBS -l nodes=1:ppn=4 #PBS -V export OMP_NUM_THREADS=4 GROMACS_PATH=/opt/gromacs GROMACS_ARGS="-nice 0 -v -cpt 5 -s md.tpr -deffnm gromacs_linux -g linux_gromacs -c 2ns.gro" source $GROMACS_PATH/bin/GMXRC.bash cd $PBS_NODEFILE echo "-- begin SMP run --" grompp ${GROMPP_ARGS} mdrun -nt ${OMP_NUM_THREADS} ${GROMACS_ARGS} echo "-- end SMP run --" |
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2楼2011-07-07 10:08:26
