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南海所老龚

新虫 (正式写手)

[求助] PCR产物直接测序与克隆菌液测序区别

各位虫友好!
有些变异较大的片段PCR产物直接测序结果很不理想,克隆送菌液测序结果很好,测出来是目的片段,为什么两者测序有如此大差别?是因为PCR产物不单一还是其他原因,请各位帮忙分析,不胜感激!
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caihy119

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
lstt09nk(金币+3): 欢迎交流 2011-06-12 19:20:42
南海所老龚(金币+1): 谢谢 2011-06-12 20:11:01
如果你的PCR产物单一,而且没有杂质,也就是引物二聚体或dNTP等(PCR产物需要纯化),那么测序的结果也是很好的。 如果做克隆测序,相当于你的PCR产物中的一条序列被纯化,测序了,所以效果是最好的, 当然需要作克隆这一步,时间和金钱花费不少!所以如果你的PCR产物很纯,即不是环境样品DNA的PCR产物,而是纯培养的细菌或其它的DNA的PCR产物,最方便的方法是PCR,纯化PCR产物,测序!
2楼2011-06-12 18:32:25
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