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奋斗1s

金虫 (正式写手)


[资源] Ubuntu 下自动安装gromacs

对于没有接触过linux语言的新手来说,安装gromacs是一件很痛苦的事情(至少对于我来说是这样),想当初安装gromacs费了很大劲,也放弃过几次。但最终还是不忍心丢弃这个软件,终于,在论坛里高手的帮助下,安装成功了。手动安装gmx论坛里指导太多了,我这次主要说下怎样自动安装吧。
首先,安装一个linux系统,ubuntu是一个很不错的选择。
其次,安装好ubuntu后,设置一下网络,让你的pc能够连上网络(和win的设置一样)。
第三步,安装gmx。使用命令:sudo apt-get install gromacs.(如果以root身份登录,不写sudo)
第一次使用ubuntu系统时,很可能会提示你没有这个没有那个,不用太担心,它提示没有什么,你就安装什么,全都可以在线搞定。安装命令和上面类似。
祝愿虫虫们安装顺利
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那是因为Ubuntu的软件库包含了大量的科研软件,比如gromacs lammps等等
3楼2011-05-30 11:33:59
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奋斗1s

金虫 (正式写手)


对,这样装是单机的,不是并行的,谢谢zh1987hs的提醒
2楼2011-05-30 10:11:34
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xufund

至尊木虫 (知名作家)


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谢谢。感觉linux应该这样才好使。
4楼2011-05-30 13:00:41
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★ ★ ★ ★ ★
ghcacj(金币+5): 谢谢 2011-05-30 16:28:22
并行版的安装
FFTW:
./configure --enable-threads --enable-float
make
make install
Cmake:
./configure
make
sudo make install
Gromacs:
./configure
make
make install
过程中提示少什么就sudo apt-get install 程序名
提示权限不够就sudo 指令名 就可以
5楼2011-05-30 16:06:18
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