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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 动植物 » 综合其他 » 请教做拟南芥分子的问题?
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biofeixue

木虫 (著名写手)

[求助] 请教做拟南芥分子的问题?

请问从http://www.arabidopsis.org/中查可设计引物的序列的问题？我想设计拟南芥某些基因的引物，做定量PCR，请问我应该查第1项的中的full length cDNA还是第4项的full length cDNA ，我怎么才能保证我的设计是跨内含子的？


  Bio Source     Source          Date                GenBank Accession         Sequence
1. mRNA           Ceres            2002-04-24                                            full length cDNA
2. genomic        AGI-TIGR      2001-01-30      NM_125664                     full length CDS
3. genomic                                                                                          full length genomic
4. genomic                                                                                          full length cDNA
5. genomic       GenBank         1993-04-27      M84700                          genomic

上述资料来自下列网页http://www.arabidopsis.org/servl ... 35732&type=gene
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1楼 2011-05-26 07:40:40
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biofeixue

木虫 (著名写手)
引用回帖:
425114楼: Originally posted by wiln1 at 2011-05-28 12:01:04:
拟南芥基因组都有了，我觉得你可以在基因组上找到这条基因，拿mRNA序列跟它比对找到内含子，然后再设计引物，这样肯定跨内含子。

谢谢！
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5楼2012-05-18 15:15:30
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apheyh

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

biofeixue(金币+5): 谢谢！ 2011-05-27 09:10:48
一点自己的想法啊，从date栏来看，好像是不同数据的更新时间不同，因此我想应该按照 4 来设计。
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2楼2011-05-27 08:23:32
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apheyh

银虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
jhu132llh(金币+4): 感谢新虫积极应助 2011-05-27 08:38:58
引用回帖:
Originally posted by apheyh at 2011-05-27 08:23:32:
一点自己的想法啊，从date栏来看，好像是不同数据的更新时间不同，因此我想应该按照 4 来设计。

不好意思，搞错了，是 1，不是4
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-05-27 08:24:55
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wiln1

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
jhu132llh(金币+4): 恩，有道理 2011-05-28 12:11:01
biofeixue(金币+5): 2011-05-28 15:00:33
拟南芥基因组都有了，我觉得你可以在基因组上找到这条基因，拿mRNA序列跟它比对找到内含子，然后再设计引物，这样肯定跨内含子。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-05-28 12:01:04
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