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琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物出现杂带
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| 我的土壤样品扩展甲烷氧化功能基因A189f-mb661b，退火温度都已经达到60°C，但还是会出现杂带，大概2000kb左右，我一直没有搞明白到底怎么回事？我做过对照，拿纯菌做，没有问题。请高手帮忙解答，谢谢！ |
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 【分子生物】EPI帖 | PCR相关 |
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2楼2011-05-24 15:04:38
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8楼2011-05-25 15:09:38
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你的marker在哪里？目的条带有多大？杂带是有点多。。。 首先温度梯度是这样设计的，先看看你两条引物的Tm值，之和然后除以2；比如算下来是55度，可以上下各扩4度，比如设5个梯度，可以是51 53 55 57 59，当然了温度梯度的间距可以小一些（退火温度不是乱设置的）； 你可以按照我说的做一下，看看哪一个温度下条带最亮，杂带最少，那么就选用此温度大量进行PCR吧。。。  |
9楼2011-05-25 15:53:01
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