应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 专业学科区 » 转基因 » 转基因植株DNA PCR检测要不就不出带，要不就连水和阴性对照都出带？？？急急急！！！
51/1返回列表
查看: 3382  |  回复: 10
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

seamuse

木虫 (著名写手)

[求助] 转基因植株DNA PCR检测要不就不出带，要不就连水和阴性对照都出带？？？急急急！！！

我最近在检测转基因植株T1和T4代DNA,用CTAB法小提的，DNA原液的浓度是3000ng/ul左右，（见附件）稀释20倍后取2微升做的模板，引物1（有师姐已经用过了，效果还挺好的）扩增的片段大小在950bp左右，25微升体系如下
buffer 2.5，
dntp 2,
引物各1微升，
taq酶（5U）0.2微升
模板 2 微升
水 16.3
扩增程序如下95 5min ,94 50s,56 40s,72 90s,35循环，72,10min.
但是扩增结果总是不好，开始是只有很少的几个样出带，（应该大部分都是阳性植株才对，因为上一代都是检测过的，）其中也包括阳性的质粒对照，见图1，
我以为是引物合成不好，就重新合成了但是结果还是不好，后来又设计了几对引物但结果还是不好，要不就是连水和转基因母本（阴性对照）都出带，要不就是还是和之前一样都不出带，从第2张图开始就是另外的引物跑的了，只要出带的都在目的带的大小左右
图1
上面的一排都没出带，就只有下排3个出带的，最后一个是阳性对照


图2
水也出带了，是什么原因啊，换了水和引物后又都不出带了，而且本来同样的体系这一次水没带，下一次又有了

图3也是同样的情况，水和阴性对照（bfck）都出带了

图4pcr，有类似于弥散的现象，还有的就是最下面很亮类似于引物二聚体，像彗星似的带，这张的图放反了，MAKER也表示反了

图5，前面的都有带，但很模糊，后面的都没有了而且拖尾现象严重，


[ Last edited by seamuse on 2011-5-18 at 18:14 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
When you want success as badly as you wanted air, you will get it.----------------------一个人只有当他把追求真理当作一种内在的需要时，才算是真正的...
1楼2011-05-18 17:51:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

谁伴我闯荡

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+5): good 2011-05-19 12:46:11
seamuse(金币+5): 非常感谢你的建议！！ 2011-05-19 13:12:05
首先排除模板污染，另外就是避免上样过程中样品漂移。只用双蒸水做一次P，看结果如何；
再找一些未转基因的样品，进行PCR，避免基因组出现错配导致的假阳性；
不出带的和弥散的，估计是引物的问题。可以考虑调整一下退火温度，检查一下引物的匹配度。
我能想到的就这些，祝楼主好运~！
赞一下(1人) 回复此楼
此生愿为扑火蛾，纵是焚化亦无悔
3楼2011-05-19 09:19:15
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

seamuse

木虫 (著名写手)
求回复啊，万分感谢！
赞一下 回复此楼
When you want success as badly as you wanted air, you will get it.----------------------一个人只有当他把追求真理当作一种内在的需要时，才算是真正的...
2楼2011-05-18 19:09:32
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

seamuse

木虫 (著名写手)
恩，谢谢，发现有水和阴性对照污染后，我就又用无菌水重新稀释的新的引物，跑了下发现水没带了，但是今天又换了对引物后（也是用灭过菌的水稀释的）水又有带了，哎，我是真郁闷了。关于退火温度，我做过梯度的，没多大用处，不太稳定！
赞一下 回复此楼
When you want success as badly as you wanted air, you will get it.----------------------一个人只有当他把追求真理当作一种内在的需要时，才算是真正的...
4楼2011-05-19 18:39:15
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

seamuse

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 谁伴我闯荡 at 2011-05-19 09:19:15:
首先排除模板污染，另外就是避免上样过程中样品漂移。只用双蒸水做一次P，看结果如何；
再找一些未转基因的样品，进行PCR，避免基因组出现错配导致的假阳性；
不出带的和弥散的，估计是引物的问题。可以考虑调整 ...

恩，谢谢，发现有水和阴性对照污染后，我就又用无菌水重新稀释的新的引物，跑了下发现水没带了，但是今天又换了对引物后（也是用灭过菌的水稀释的）水又有带了，哎，我是真郁闷了。关于退火温度，我做过梯度的，没多大用处，不太稳定！
赞一下 回复此楼
When you want success as badly as you wanted air, you will get it.----------------------一个人只有当他把追求真理当作一种内在的需要时，才算是真正的...
5楼2011-05-19 21:34:22
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭