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conewq

银虫 (初入文坛)

[求助] 能否用Pipeline Pilot将核酸序列转为结构?

小弟现在有一些核酸序列(形如:GAAATGGATCCGCT...)。想用pipeline pilot批量转成三维结构(mol2之类),不知道pipeline pilot里面有没有能够实现这一功能的component?若没有的话,请问各位大侠有没有其他软件可以批量转核酸序列为结构的?多谢~~
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conewq

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by ts2009 at 2011-05-14 15:03:08:
弄了个简单的,你试试。

你好 我试了下 但是Mol2 Writer报错 错误信息为:Data type "SciTegic.interface.iMolecule" is not found in the current data record. 我先用DS生成了序列的输入文件(*.bsml)。我用Accelrys DS Visualizer替换了Mol2 Writer,也会报类似的错误:The expression tried to calculate the property "coorddimension"  but the calculation failed: Data type "SciTegic.data.Molecule" is not found in the current data record.
不知道是不是还是输入文件的问题。



3楼2011-05-15 12:58:39
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