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做DGGE的童鞋们,有人做过主成分分析(PCA)吗?
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2011-05-04 22:51:50
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1562160楼
:
Originally posted by
kerrylee_tw
at 2012-05-30 18:56:49
恩,能否给我说说文献的标题呢?我有一点不清楚的地方就是,如果用Qty值的话,每个样品条带数量并不对等,如果用SPSS的话,好像只算所有对待的数据,这样如何解决?...
是用相对数量
每个条带的Qty值/每个泳道所有条带的Qty值之和
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xuxingche
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17楼
2012-05-31 19:17:02
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xukewei
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小木虫(金币
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):给个红包,谢谢回帖
DGGE做PCA不太好,因为你用0或1代表条带的有无,但相对丰度信息被忽略了
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3楼
2011-05-05 16:47:26
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2011-05-05 17:06:09
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xukewei
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Originally posted by
kerrylee_tw
at 2011-05-05 17:06:09:
我就用INT那个得分来做,不用你说的那种方法哈,你做过吗?
我做的是T-RFLP的排序分析
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5楼
2011-05-05 18:33:48
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