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南海所老龚

新虫 (正式写手)

[求助] 为什么DNA测序每个反应只能准确测出大约500bp

大家好,本人刚接触分子生物学,遇到一个问题,向各位大侠请教:
为什么DNA测序每个反应只能准确测出大约500bp?如果再测的话峰变得杂,结果就不准了。
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yabxxh

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
reasonspare(金币+2): 谢谢分享 2011-04-26 11:20:44
不是说只能测出500bp,只是说引物后端50bp左右的片段会测不准,现在一般都能测到700bp以上了
2楼2011-04-26 09:02:50
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南海所老龚

新虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by yabxxh at 2011-04-26 09:02:50:
不是说只能测出500bp,只是说引物后端50bp左右的片段会测不准,现在一般都能测到700bp以上了

为什么700bp以后据测不准了呢?
TheBestandMostBeautifulThingsintheWorldCan'tBeSeenorTouched,TheyMustBeFeltwithHeart.
3楼2011-04-26 09:05:47
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jhu132llh

荣誉版主 (知名作家)

大洪

【答案】应助回帖

★ ★
reasonspare(金币+2): 谢谢分享 2011-04-26 11:21:00
南海所老龚(金币+1): 2011-04-26 12:31:54
因为是酶的问题
测序用的酶没有外切酶活性,所以不会校对碱基能力,只有在500bp内具有准确性
,再长了就人家就不对多余的测序结果的准确性负责任
当然了,随着科学的进步这个是会越来越长的,现在不就有700bp了嘛
将来会越来越好的
青春的岁月,我们身不由己,只因这胸中燃烧的梦想!
4楼2011-04-26 09:34:36
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zgb1982

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

目前在一个公司测序,基本能测到900BP是准确的了
5楼2011-04-26 11:14:27
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


lstt09nk(金币+1): 感谢交流~ 2011-04-26 22:30:03
是滴~不光与酶有关,并且与你反应体系,跑胶的速度误差有关(如果是毛细管测序的话~)
6楼2011-04-26 14:30:17
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beibei9535

荣誉版主 (职业作家)

晕晕小版主~ 姑娘你好!

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

出现杂峰就不能要了,所以我们一般以800bp为基准。过了就要做两个到多个反应了、
与酶活也有关系。
最好是做双向测序了~
最好的年龄是,那一天,终于知道并且坚信自己有多好,不是虚张,不是夸浮,不是众人捧,是内心明明澈澈知道:是的,我就是这么好。
7楼2011-05-02 11:30:35
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南海所老龚

新虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by beibei9535 at 2011-05-02 11:30:35:
出现杂峰就不能要了,所以我们一般以800bp为基准。过了就要做两个到多个反应了、
与酶活也有关系。
最好是做双向测序了~

嗯嗯,相信技术在进步,以后说不定一个反应就能搞定了。
TheBestandMostBeautifulThingsintheWorldCan'tBeSeenorTouched,TheyMustBeFeltwithHeart.
8楼2011-05-02 12:33:16
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