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游子8921铁杆木虫 (知名作家)
游子8921
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[求助]
Autodock对接构象有问题，请教
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这是复合物配体正确的坐标 HETATM 1 C 0 3.265 15.861 8.883 0.00 0.00 0.099 A HETATM 2 C 0 2.378 15.883 7.803 0.00 0.00 0.040 A HETATM 3 C 0 2.690 15.245 6.605 0.00 0.00 0.014 A HETATM 4 C 0 4.481 15.174 8.743 0.00 0.00 0.102 A HETATM 5 C 0 4.782 14.541 7.540 0.00 0.00 0.051 A HETATM 6 C 0 3.906 14.555 6.435 0.00 0.00 -0.033 A HETATM 7 O 0 2.997 16.490 10.083 0.00 0.00 -0.358 OA HETATM 8 H 0 3.803 16.440 10.620 0.00 0.00 0.218 HD HETATM 9 O 0 5.415 15.160 9.766 0.00 0.00 -0.353 OA HETATM 10 C 0 6.402 14.141 9.652 0.00 0.00 0.210 C HETATM 11 C 0 4.287 13.865 5.199 0.00 0.00 0.018 C HETATM 12 C 0 4.993 14.348 4.162 0.00 0.00 0.085 C HETATM 13 C 0 5.326 13.517 2.905 0.00 0.00 0.198 C HETATM 14 O 0 4.407 13.416 2.053 0.00 0.00 -0.645 OA HETATM 15 O 0 6.492 13.045 2.906 0.00 0.00 -0.645 OA 这是对接后配体坐标 HETATM 1 C 0 3.265 15.861 8.883 0.00 0.00 0.099 A HETATM 2 C 0 2.378 15.883 7.803 0.00 0.00 0.040 A HETATM 3 C 0 2.690 15.245 6.605 0.00 0.00 0.014 A HETATM 4 C 0 4.481 15.174 8.743 0.00 0.00 0.102 A HETATM 5 C 0 4.782 14.541 7.540 0.00 0.00 0.051 A HETATM 6 C 0 3.906 14.555 6.435 0.00 0.00 -0.033 A HETATM 7 O 0 2.997 16.490 10.083 0.00 0.00 -0.358 OA HETATM 8 H 0 3.803 16.440 10.620 0.00 0.00 0.218 HD HETATM 9 O 0 5.415 15.160 9.766 0.00 0.00 -0.353 OA HETATM 10 C 0 6.402 14.141 9.652 0.00 0.00 0.210 C HETATM 11 C 0 4.287 13.865 5.199 0.00 0.00 0.018 C HETATM 12 C 0 4.993 14.348 4.162 0.00 0.00 0.085 C HETATM 13 C 0 5.326 13.517 2.905 0.00 0.00 0.198 C HETATM 14 O 0 4.407 13.416 2.053 0.00 0.00 -0.645 OA HETATM 15 O 0 6.492 13.045 2.906 0.00 0.00 -0.645 OA 明显差别较大，我看了构象，对接后配体平躺着。这该怎么处理？请指教 我上传两张图片，第一张是复合物中配体正确构象，第二张是对接后的构象   |
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chemozhang
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