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化工人2010

木虫 (小有名气)

[求助] SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳求助

SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳的电压、电流与跑电泳时间怎么确定啊, 恒压 还是恒流  浓缩胶和分离胶浓度由什么决定啊
我做的是羊毛的溶解,附件是我的羊毛蛋白的电泳图 条件:分离胶15%, 浓缩胶5%, 垂直平板电泳, 加样量为7μL。电极缓冲液为Tris-HCl( pH 8.3)系统。电流40mA,浓缩胶电压100v,分离胶电压150v。
条带很模糊,这是什么原因啊 。是不是羊毛的溶解 分子量较杂 还是因为蛋白溶液不纯的原因呢?
我不想测很精确 只想知道一个大概的范围 你看我们的谱图 是不是只要染上色的地方 就能说是有那个范围的蛋白吗 就是4.1KD-66KD的蛋白都有吗  我们现在又买了一个14.4KD-96KD的marker 不过还是那样  很模糊,整个柱都有颜色
郁闷!
哪位做过凝胶电泳的虫友给指点一下 啊
不胜感激!
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我还年轻,我渴望上路。
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
silicare(金币+5, EPI+1): 2011-04-21 08:35:54
ladder跑得好,说明电泳胶、电泳液、电压电流没问题,给我的感觉是
1、拖带
样品中整个泳道都看不出明显的单条蛋白质带,说明有可能样品的制备有问题。
2、形状
样品中即使是拖带,从加样孔到后面,形状也不是呈倒梯形,而是中间有突出,所以我猜测可能有蛋白质样品在内,而且不止是一种蛋白质。
3、上样量
考马斯亮蓝染色还是比较敏感的,这么蓝,说明可能蛋白质很多,建议做一个上样量梯度,可以将样品进行2倍为一个梯度,做几个稀释梯度再上样跑,看看会不会有蛋白质条带。
4、样品处理
我跑SDS-PAGE从来不煮,所以我觉得不煮也没关系,反正已经有SDS了,但是稳妥起见,还是煮了算了,起码减少一个不确定因素。
5、浪费
一块胶10个上样孔,你有五个没用上,下次设计严谨一些,总会有些有趣的东西可以一起跑的。
流星来时我许了个愿,愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具,久不看论坛一来就提问者,宁弃EPI和VIP也不回帖。
3楼2011-04-20 22:22:55
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

【答案】应助回帖

★ ★
silicare(金币+2): 有道理 2011-04-21 08:36:04
化工人2010(金币+5): 2 2011-04-21 11:59:00
看你的marker跑的还是不错的,所以你的电泳可能也不存在什么问题。不知道你羊毛溶解用的是什么溶剂。。。溶解之后有煮一下变性么?
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
2楼2011-04-20 21:22:53
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化工人2010

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2011-04-20 21:22:53:
看你的marker跑的还是不错的,所以你的电泳可能也不存在什么问题。不知道你羊毛溶解用的是什么溶剂。。。溶解之后有煮一下变性么?

不用煮了吧!我们的羊毛蛋白溶液就是在80℃下溶解得到的,不过我们加不加SDS,跑出来都是那样
我还年轻,我渴望上路。
4楼2011-04-21 12:47:41
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我要长大

银虫 (初入文坛)

Marker跑的不错,要不做个样品梯度稀释??
5楼2011-06-26 17:07:53
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