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gigiwq

新虫 (初入文坛)

[求助] 定量pcr的污染问题

大家好!最近在做定量,但是不知道什么原因空白对照也出现扩增。情况是这样的:我用CDNA模板做了5个梯度稀释,准备先做标准曲线。出来的结果浓度大的3个模板扩增曲线的ct值都相隔一定值,比较正常;浓度小的那2个曲线较接近了;而且那个空白对照也有扩增。
我分析应该不会是二聚体,因为溶解曲线只有一个峰,而且扩增曲线随着模板浓度的减小而后移。大觉觉得是这样吗?
我先以为是气溶胶污染,然后换了个地方做,还是有阴性扩增

后来我去别人的实验室做,用的人家的枪和实验室,就没有扩增了

所以我觉得可能是我的枪污染了,我同学的实验室不方便去了,我换了个从没做过分子实验的地方做,又换了我实验室的别的枪做,还是有阴性扩增

最后我买了那种带滤膜的枪头,不知道大家用过吗?就是枪头上有那种滤膜,说是可以防污染的,用了之后还是有阴性扩增。
请问谁知道怎么办啊?或者帮我出出主意啊,我实在是没办法了,每次都有扩增。谢谢大家帮忙!
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gigiwq

新虫 (初入文坛)

谢谢大家帮帮忙
2楼2011-04-18 16:32:36
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保护你的大树

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我发现定量方面的大家发言都很少也,我也是刚做定量,不是很清楚,
3楼2011-04-19 09:58:49
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tingspdf

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

管子是不是不干净?
4楼2011-04-19 11:10:46
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

有时候引物不好,用水做模板也会看到有扩增。一般,阴性对照35个循环之后才出现扩增曲线,也算是正常的啦。

“我分析应该不会是二聚体,因为溶解曲线只有一个峰,而且扩增曲线随着模板浓度的减小而后移。”这个分析是正确的。

“浓度小的那2个曲线较接近了”有可能是稀释浓度太低了。如果到30个循环之后才出现扩增曲线,最好考虑采用浓度更大的点来做标准曲线。
5楼2011-04-19 14:15:51
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lanhuaorchid

金虫 (著名写手)

orchid

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
请问你的问题解决了么,我最近也也遇到相同的问题,悲剧的阴性对照呀
我也用了那种带滤芯的枪头,还是不行,怎么解决的呢,谢谢
orchid
6楼2012-03-27 16:26:39
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一申二心

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
924447楼: Originally posted by gigiwq at 2011-04-18 16:30:52
大家好!最近在做定量,但是不知道什么原因空白对照也出现扩增。情况是这样的:我用CDNA模板做了5个梯度稀释,准备先做标准曲线。出来的结果浓度大的3个模板扩增曲线的ct值都相隔一定值,比较正常;浓度小的那2个曲 ...

请问你的问题解决了吗?
我遇到和你一样的问题了,不过我的换了地方还是一样。我把对照和实验组哪去测序了,结果一样,证明是污染
7楼2012-06-07 14:37:29
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