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【求助/交流】限制性内切酶保护碱基
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xwsooo
银虫
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虫号: 1014771
[交流]
【求助/交流】限制性内切酶保护碱基
最近要准备做酶切,我不太懂内切酶保护碱基什么意思?引物已经拿给公司合成去了,我并没有考虑到设计什么保护碱基,这有关系么?
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1楼
2011-04-10 22:17:22
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空谷幽风
金虫
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小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+3): good 2011-04-11 12:40:58
设计引物的时候在5‘端添加4-5个碱基就可以,只要对GC含量没什么大影响,不产生二级结构就可以了
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8楼
2011-04-11 12:20:52
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西瓜
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xwsooo(金币
+1
):谢谢参与
dhd997(金币+6, EPI+1): good 2011-04-11 12:40:34
引用回帖:
Originally posted by
xwsooo
at 2011-04-10 22:17:22:
最近要准备做酶切,我不太懂内切酶保护碱基什么意思?引物已经拿给公司合成去了,我并没有考虑到设计什么保护碱基,这有关系么?
限制性内切酶识别特定的DNA序列,除此之外,酶蛋白还要占据识别位点两边的若干个碱基,这些碱基对内切酶稳定的结合到DNA双链并发挥切割DNA作用是有很大影响的,被称为保护碱基。
其实保护碱基没有必要太纠结,在引物的酶切位点外面再加3个以上的碱基就可以了。这里说得很详细,还五颜六色滴,我就不粘过来啦:
http://www.bioask.cn/html/86.html
特别赞成这句:添加保护碱基时,最关心的应该是保护碱基的数目,而不是种类。
以前NEB弄了个保护碱基的表,还放在他们的产品目录里。不过现在的产品目录已经没有这个表了,说明NEB也意识到没必要纠结保护碱基的种类了。
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2楼
2011-04-10 22:36:28
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zhaohq1209
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):谢谢参与
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Originally posted by
西瓜
at 2011-04-10 22:36:28:
限制性内切酶识别特定的DNA序列,除此之外,酶蛋白还要占据识别位点两边的若干个碱基,这些碱基对内切酶稳定的结合到DNA双链并发挥切割DNA作用是有很大影响的,被称为保护碱基。
其实保护碱基没有必要太纠结 ...
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3楼
2011-04-10 23:45:09
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gongeleven
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Originally posted by
roomofxw
at 2011-04-11 09:13:15:
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好办法
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6楼
2011-04-11 11:11:28
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