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liuwei78

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】质粒双酶切连接问题 已有7人参与

有一个关于质粒双酶切的问题一直没弄明白。
双酶切连接转化完以后,一个菌里面会不会有许多不同大小的质粒存在。有的是酶切连接正确的,有的是质粒自身连接的,还有的是没有连接上的。
如果是这样的话,那么提质粒其实是把这些不同大小的质粒都提取出来了么?
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panda73

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
送鲜花一朵
其实,这是一个很好的问题。
连接时,如楼主所说,会出现各种连接产物:包括载体A:单载体分子的自连产物,B:两个载体分子的自连产物,C:目的基因与载体正确连接的产物,D:两个目的基因的自连产物等等
转化时,这些不同的连接产物,完全有可能进入同一个感受态细胞。但是这些连接产物中,只有两种是可以复制的:那就是A和C
那为什么在通常情况下,没有出现一个单克隆中出现两种不同的质粒呢?
事实上,这就涉及到质粒的一个特性:质粒的不相容性。一般认为,如果两种质粒的复制原点相同,那么这两个质粒不可能共存于同一个大肠杆菌细胞中(即在分裂时,一般为随机丢失一种质粒,最终表现为只有一种质粒存在于一个单克隆中)。质粒不相容性的原因有些不同的假说,貌似到现在还不是特别清楚。
但是质粒的不相容性也就保证了单克隆中只有一种质粒,虽然我们不知道为什么。这也是能够进行分子克隆的一个基本原理。
但现在越来越多的事实表明,质粒的不相容性并不是那么严格,这个现象在文库构建时表现的比较明显,在单克隆测序时,经常会发现出现重峰现象,这通常就是因为单克隆繁殖起来的群体中含有两种质粒(插入序列不同的克隆)
8楼2012-03-27 21:50:32
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
,罚你看一遍 吴乃虎 的基因工程原理
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
2楼2011-02-28 14:14:44
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+1): 鼓励下 2011-02-28 17:02:44
是啊,你可以把提取出来的质粒酶切验证一样就可以了,要么进行pcr验证也行!
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
3楼2011-02-28 14:15:20
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weishengsu5

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
rainwander(金币+1): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-02-28 17:02:06
lstt09nk(金币+1): 感谢交流 2011-02-28 17:02:28
引用回帖:
Originally posted by liuwei78 at 2011-02-28 14:10:31:
有一个关于质粒双酶切的问题一直没弄明白。
双酶切连接转化完以后,一个菌里面会不会有许多不同大小的质粒存在。有的是酶切连接正确的,有的是质粒自身连接的,还有的是没有连接上的。
如果是这样的话,那么提质 ...

连接以后肯定会存在这种情况,但是我们在进行连接的时候一般都把抗青霉素的基因作为筛选标记,所以就不会出现没有连接上的情况了,至于自身连接的问题,可以把酶切后的片段用碱性磷酸酶处理去磷酸化,这样就不会出现自身连接的情况了
4楼2011-02-28 15:33:41
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