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[交流]
【求助/交流】如何用PAUP 进行形态学分支分析,开始如何建立next 文件?
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| 要用PAUP做分支分析,一开始建立的文件都是文本,怎么才能变成NEXT 格式呢?直接改文件名末尾也不行。开始可以运行但最后老是出问题导致paup 退出。希望高手解惑啊。由于是形态学性状编码,不是先调整DNA序列再从其他软件中输出的next格式,摸不得头啊 |
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2楼2011-04-13 17:48:59
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
amisking(金币+25): 楼主要求奖励! 2011-12-22 18:21:27
amisking(APEPI+1): 2011-12-22 18:21:34
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
amisking(金币+25): 楼主要求奖励! 2011-12-22 18:21:27
amisking(APEPI+1): 2011-12-22 18:21:34
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如果是.phy倒是可以用命令直转换,要不你借鉴下看行不行吧,文本文档中输入: #nexus Begin paup; toNexus format=phylip fromfile=myfile(英文或数字,勿中文).phy tofile=myfile.nxs datatype=DNA interleave=yes; End; 用paup打开该文本文档,excute文档,保证你要转化的文件也在这个文档的同一文件夹内。 或者说吧文本在paup里open是选edit,将文本文档编辑成 #nexus Begin paup; matrix 1······自己序列 2 1 2 ; end; 编辑完保存下,用FILE里的excute “myfile”选项是不是也可以啊,但是编辑过程应该挺麻烦的 |
3楼2011-04-26 14:22:09
4楼2016-05-12 09:02:11














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