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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】请哪位大侠帮我分析下 几个简并引物 谢谢
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aaron2012

银虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】请哪位大侠帮我分析下 几个简并引物 谢谢

首先在这里祝大家新年快乐，新的一年里试验顺利。
最近一直做3‘RACE，但是老是得不到自己想要的片段，即使有时候能P出来，送测回来也不是目的片段。今天我又设计了几个引物。烦请高手帮我分析下，看可行不可行：1：5’-GAGCCYGGHGGYCAGTTGAR-3‘      2：5’-CCATNATGCCMAAGGGVAGVAT- 3‘       3：5’-TGTDCAGGTBAAYCTKGAYTT-3‘
4：5’-ACCTGACCACHATHTTYCCHGAG-3‘
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1楼 2011-01-03 13:02:34
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aaron2012

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by brightfuture01 at 2011-01-03 14:06:04:
这样看着感觉还行，简并度也适中。这几条里面我感觉第一条设计的看起来最不好，兼并碱基R处在3‘的尽头了。要是我的话我就将它砍掉不要了。

谢谢您的意见,您会用软件不,能不帮我用软件分析下 .
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3楼2011-01-03 14:34:34
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)
★ ★
aaron2012(金币+1):谢谢参与
rainwander(金币+1):鼓励积极参与~~~ 2011-01-03 15:28:59
这样看着感觉还行，简并度也适中。这几条里面我感觉第一条设计的看起来最不好，兼并碱基R处在3‘的尽头了。要是我的话我就将它砍掉不要了。
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2楼2011-01-03 14:06:04
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linqin1029

新虫 (初入文坛)
★ ★
aaron2012(金币+1):谢谢参与
rainwander(金币+1): 鼓励参与交流~~~ 2011-03-01 22:42:05
简并度可以，一般简并碱基个数小于等于四，3‘末端不要设简并，3‘末端最好是C或G.
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4楼2011-03-01 21:35:55
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