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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】新物种的引物设计问题
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zhangfei7706

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】新物种的引物设计问题

我需要找到豚鼠的HMG CoAR基因，但NCBI上没有，所以查到了其它物种的序列，找到保守性，设计引物，但总是P不出来。请问有没有什么更好的方法呢？我P的基因大小基本上是600bp左右。请高手指教！谢谢！
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1楼 2010-12-22 14:29:10
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rioarsenal

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by zhangfei7706 at 2010-12-22 14:29:10:
我需要找到豚鼠的HMG CoAR基因，但NCBI上没有，所以查到了其它物种的序列，找到保守性，设计引物，但总是P不出来。请问有没有什么更好的方法呢？我P的基因大小基本上是600bp左右。请高手指教！谢谢！

根据保守区，设计简并引物，一般都是可以的。

如果实在不行，那就酶切，杂交，克隆，测序。。。
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3楼2010-12-22 14:34:27
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)
zhangfei7706(金币+1):没有设计兼并引物，只是随机找了一个。谢谢提醒啊！ 2010-12-23 09:50:15
不知道你找到保守序列后设计的是不是兼并引物。
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2楼2010-12-22 14:31:19
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