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木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】蛋白提取过程中遇到的问题与困惑

从hela细胞中提取总蛋白质,然后酶解,进行蛋白组层次的分析
   
     具体方法是:
     用的是pH=7.4的tris-hcl,8M尿素,加了各种的酶抑制剂,然后超声破碎细胞,破碎液离心后,上清液用有机溶剂沉淀法沉淀蛋白质。

      在这个过程中遇到的第一个问题是,1)裂解液中同时加了cocktail和PMSF,师兄说加了cocktail之后,PMSF就没有必要加了,而且cocktail用量是1%,我用了2%。    究竟PMSF加不加有没有影响????
     2)由于PMSF半衰期短,我是随用随加的,而且是加完之后,立刻用于超声破碎细胞。但是我发现PMSF在裂解液中没有完全溶解,大部分还沉淀在底部。这样进行超声破碎,不知道PMSF还能不能起作用????
     3)我超声破碎细胞的时候,是3s/3s/60次,400w,总共180次,可是我发现裂解液还是很浑浊,裂解到240次,理解液还是很浑浊。
      请问超声次数太多,对蛋白有哪些危害?危害大么?理论上,破碎后的裂解液应该是什么情况????
      4)在采用有机溶剂沉淀蛋白的时候,我是在-20℃预冷,加入后,在-20℃过夜(这个时间从12-18h不等),然后进行离心洗涤的。我看有的人说有机溶剂沉淀之后要马上离心,以获得活性蛋白。但是我要的是总蛋白,然后酶解,做蛋白组分析,应该不用保证活性把?????
     5)蛋白在冻干后复溶,测定浓度的时候,一般要在4℃摇床上面溶解多久啊,我的都将近八个小时才溶解完全!
     还有,如果我没有完全溶解的情况下,就将溶解液包括不容物在-20度冻起来,等我下次使用的时候,怎么样才能使那些没有溶解的蛋白继续溶解?????

    问题很多,还望高手解答,谢谢!
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