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【求助/交流】基因鉴定问题
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小丁山
铜虫
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专业: 食品科学基础
[交流]
【求助/交流】基因鉴定问题
已有5人参与
如何根据相近种属的产糖基因序列来克隆或者推测一株新筛出菌产糖基因,从而鉴定产糖基因?此外PCR引物该如何设计呢?本人跨专业,对分子方面的东西不甚了解,望高人指点。
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1楼
2010-09-26 13:48:08
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yierangel
金虫
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专业: 微生物资源与分类学
★
小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
同意楼上的。
还可以通过Tn5转座插入的方法先将未知产糖基因沉默后,再根据转座子的序列设计引物,利用染色体步移法将该基因PCR扩增后进行测序。
该方法主要用于未知基因的发现,如果是已知基因的话就用楼上的方法即可。
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3楼
2010-09-27 18:21:42
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banhf
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虫号: 1070255
注册: 2010-08-06
性别: GG
根据该基因的保守序列设计引物,从新菌株中进行PCR,得到PCR产物后可测序验证。
引物的设计有专门的设计软件。
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2楼
2010-09-27 10:50:14
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阳光金鱼唐
金虫
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红花: 6
帖子: 1022
在线: 179.8小时
虫号: 959172
注册: 2010-03-01
性别:
MM
专业: 计算机软件
用DNAStar、Primer5.0设计引物,一定要找保守区设计,否则很难扩出来
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不知道什么是生活了,也不知道生活是什么了
4楼
2010-09-27 19:19:31
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小丁山
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注册: 2010-09-15
专业: 食品科学基础
引用回帖:
Originally posted by
yierangel
at 2010-09-27 18:21:42:
同意楼上的。
还通过Tn5转座插入的方法先将未知产糖基因沉默可以后,再根据转座子的序列设计引物,利用染色体步移法将该基因PCR扩增后进行测序。
该方法主要用于未知基因的发现,如果是已知基因的话就用楼上的方 ...
如何才能通过Tn5转座插入的方法将未知产糖基因沉默?那盲目性不是很高啊?
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5楼
2010-10-12 15:37:24
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